[发明专利]用于优化异源蛋白质生产的核糖体动力学建模有效
申请号: | 201680005182.9 | 申请日: | 2016-01-06 |
公开(公告)号: | CN107109496B | 公开(公告)日: | 2021-06-22 |
发明(设计)人: | 斯科特·科尔·乌;唐纳德·L·比策 | 申请(专利权)人: | 北卡罗来纳州立大学 |
主分类号: | G16B5/00 | 分类号: | G16B5/00 |
代理公司: | 北京睿邦知识产权代理事务所(普通合伙) 11481 | 代理人: | 徐丁峰 |
地址: | 美国北卡*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | 目前公开的主题提供了基于自由能的翻译延伸模型以预测和优化异源基因表达。该模型和软件允许基因的预测和优化,以增加或降低蛋白质产量和增加或减少蛋白质聚集。 | ||
搜索关键词: | 用于 优化 蛋白质 生产 核糖体 动力学 建模 | ||
【主权项】:
一种用于预测基因翻译的蛋白质产量的方法,所述方法包括:(a)确定在编码蛋白质的mRNA的编码区中每个密码子处的核糖体等待时间,包括确定在每个密码子处的周期数,其中所述周期数是tRNA丰度、核糖体移位量级和来自mRNA与核糖体的3'端rRNA尾巴之间结合的力的函数;和(b)确定经过遍及编码区的密码子的总周期计数;其中所述经过遍及编码区的密码子的总周期计数与蛋白质产量相关。
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