[发明专利]用于高通量微生物学应用的高分辨率系统、试剂盒、设备和方法

摘要

描述了用于培养来自样品的细胞的界定高密度微孔阵列的微加工装置。可以在微孔中加入一系列独特标签以鉴定一个或多个种类的细胞并定位其中培养每个种类的特定微孔。独特标签可以是核酸分子，其包含用于与靶标核酸片段退火的靶标特异性核苷酸序列和预先确定用于鉴定一个或多个微孔的位置特异性核苷酸序列。可以孵育装置以生长多个细胞，其可以分为分析部分和保留部分。描述了用于培养、筛选和测定来自样品的细胞的相对和/或绝对丰度的高通量方法。

主权项

一种方法，包括：获得用于培养来自样品的至少一个细胞的界定高密度微孔阵列的微加工装置，所述高密度微孔阵列的至少一个微孔包含所述至少一个细胞和至少一个独特标签，所述至少一个独特标签用于鉴定其中培养至少一个种类的至少一个细胞的高密度微孔阵列的至少一个微孔，所述至少一个独特标签包含核酸分子，所述核酸分子包含：靶标特异性核苷酸序列，用于与至少一个目标种类的至少一个细胞中存在的靶标核酸片段退火；和位置特异性核苷酸序列，用于鉴定所述高密度微孔阵列的所述至少一个微孔；孵育所述微加工装置以从所述高密度微孔阵列的至少一个微孔中的至少一个细胞生长多个细胞；将所述高密度微孔阵列的至少一个微孔中的多个细胞分割成第一部分的多个细胞和第二部分的多个细胞，所述至少一个独特标签保持与所述至少第一部分的多个细胞在一起；分析所述第一部分的多个细胞，以：测定所述至少一个目标种类；和基于所述至少一个独特标签鉴定其中培养所述至少一个目标种类的高密度微孔阵列的至少一个微孔；和基于鉴定的其中培养所述至少一个目标种类的高密度微孔阵列的至少一个微孔，在所述第二部分的多个细胞内定位所述至少一个目标种类。