[发明专利]分子质量保证方法在测序中的应用在审

专利信息
申请号: 201680054659.2 申请日: 2016-09-23
公开(公告)号: CN108137642A 公开(公告)日: 2018-06-08
发明(设计)人: 塞缪尔·阿帕里西奥;苏赫拉布·沙哈;罗莎莉娅·阿吉雷-赫尔南德斯;利亚·普伦蒂斯;帕特里克·弗兰奇尼;伽斯文德·辛格·卡哈特拉;贺童 申请(专利权)人: 语境基因组学有限公司
主分类号: C07H21/04 分类号: C07H21/04;C12P19/34;C12Q1/68;C40B50/06;G06F19/10;G06F19/20
代理公司: 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙) 31257 代理人: 董红曼
地址: 加拿大不列*** 国省代码: 加拿大;CA
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摘要: 发明涉及用于扩增技术(例如下一代测序技术(NGS))的质量保证方法。
搜索关键词: 质量保证 测序技术 测序 扩增 应用
【主权项】:
一种确定核酸模板复杂度的方法,包括:i)提供一个核酸模板;ii)提供多个引物对,其包括第一引物和第二引物,其中所述第一引物包括与所述核酸模板的一部分互补的序列,所述第二引物包括与所述核酸模板的互补序列的一部分互补的序列;iii)将代码连接到所述第一引物的5’末端、所述第二引物的5’末端或两者之上,以形成代码‑引物分子,或将代码连接到所述核酸模板上以形成代码‑模板分子;iv)用所述配对的代码‑引物分子和核酸模板,或用所述引物对和代码‑模板分子进行确定循环数的扩增反应,以获得扩增反应产物;v)在每个循环结束时、在确定的循环数结束时,或在任一中间的循环数时,获得扩增反应产物的序列;vi)在每个循环结束时、在确定的循环数结束时、或在任一中间的循环数时,确定扩增反应产物中每个代码的丰度;vii)确定每个循环所观测到的代码熵;以及viii)将观测到的代码熵与估算的代码熵进行比较,来确定核酸模板的复杂度。
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