[发明专利]通过调节子富集测定进行的蛋白质活性的虚拟推断有效
| 申请号： | 201680062241.6 | 申请日： | 2016-08-26 |
| 公开（公告）号： | CN108351915B | 公开（公告）日： | 2022-09-09 |
| 发明（设计）人： | 马里亚诺·贾维尔·阿尔瓦雷茨;安德里亚·卡利法诺 | 申请（专利权）人： | 纽约市哥伦比亚大学信托人 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00;G16B20/20;G16B25/00;G16B25/10;G16B5/00;G16B5/20 |
| 代理公司： | 中科专利商标代理有限责任公司 11021 | 代理人： | 吴小明 |
| 地址： | 美国*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | 本文公开了用于测定基因表达标记中的调节子富集的方法。实例性方法可包括获得调节子的一组转录靶标。所述方法可包括通过将测试样品的基因表达谱与代表对照表型的多个样品的基因表达谱进行比较来获得基因表达标记。所述方法可包括计算所述基因表达标记中每一调节子的调节子富集得分。所述方法可包括确定所述对照表型中的对照样品的数目是否高于预定阈值以支持使用重排测定来评估统计显著性。所述方法可包括，响应于确定所述对照样品的数目高于所述预定阈值，通过将每一调节子富集得分与空模型进行比较来计算显著性值。 | ||
| 搜索关键词： | 通过 调节 富集 测定 进行 蛋白质 活性 虚拟 推断 | ||
【主权项】：
1.一种测定基因表达标记中调节子富集的方法，所述方法包括：(a)获得调节子的一组转录靶标；(b)通过比较测试样品的基因表达谱与代表对照表型的多个样品的基因表达谱获得基因表达标记；(c)计算所述基因表达标记中每一调节子的调节子富集得分；(d)确定所述对照表型中对照样品的数目是否高于预定阈值以支持使用重排测定评估统计显著性；和(e)响应于确定所述对照样品的数目高于所述预定阈值，通过比较每一调节子富集得分与空模型来计算显著性值。
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