[发明专利]使核酸移位通过纳米孔的方法在审

专利信息
申请号: 201680072002.9 申请日: 2016-11-28
公开(公告)号: CN108473933A 公开(公告)日: 2018-08-31
发明(设计)人: 洪涛;卡尔·盖格勒;简·F·西蒙斯 申请(专利权)人: 昆塔波尔公司
主分类号: C12M1/34 分类号: C12M1/34;C12Q1/6816;C12Q1/6869
代理公司: 北京安信方达知识产权代理有限公司 11262 代理人: 李平;郑霞
地址: 美国加利*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 发明提供了使用允许单链多核苷酸但不允许双链多核苷酸通过的纳米孔用于分析多核苷酸的方法。根据一些实施方案,产生包含具有单链尾部或突出端的标记的链的双链产物。在跨一个或更多个纳米孔的电场存在下,将双链产物暴露于一个或更多个纳米孔,使得单链尾部可以被捕获并且标记的链从双链产物解链并被移位。选择反应混合物的离子组成和电场强度,以便核苷酸以小于1000个核苷酸/秒的速率移位通过纳米孔。
搜索关键词: 纳米孔 移位 双链 核苷酸 单链 选择反应混合物 单链多核苷酸 双链多核苷酸 电场 多核苷酸 离子组成 使用允许 核酸 解链 暴露 分析
【主权项】:
1.一种分析核酸的方法,包括:在反应混合物中使具有5'非互补尾部的引物在模板上延伸以产生包含标记的延伸链和作为单链突出端的所述5'非互补尾部的双链产物;提供至少一个纳米孔,所述至少一个纳米孔提供在第一室和第二室之间的流体连通,其中所述至少一个纳米孔的每个纳米孔能够使单链核酸而不是双链核酸通过;将所述双链产物布置在所述第一室中;通过施加跨所述纳米孔的电场,使所述双链产物的5'非互补尾部被所述至少一个纳米孔捕获;通过施加的电场以小于1000个核苷酸/秒(nt/sec)的速率使捕获的双链产物的标记的延伸链移位通过所述纳米孔,其中随着所述双链产物的移位链进入所述纳米孔,所述双链产物的移位链被解链。
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