[发明专利]用于编码和解码数据结构的质量值的方法在审
| 申请号： | 201680091520.5 | 申请日： | 2016-10-12 |
| 公开（公告）号： | CN110168650A | 公开（公告）日： | 2019-08-23 |
| 发明（设计）人： | J·伏格斯;M·海纳斯;J·奥斯特曼 | 申请（专利权）人： | 汉诺威戈特弗里德威廉莱布尼茨大学;斯坦福大学 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00;H03M7/30 |
| 代理公司： | 北京市中伦律师事务所 11410 | 代理人： | 杨黎峰;钟锦舜 |
| 地址： | 德国*** | 国省代码： | 德国;DE |
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| 摘要： | 本发明涉及用于编码数据结构的质量值的方法，其中，所述数据结构包括多个连续片段，每个连续片段包括从符号字母表导出的符号序列并且对应于一个或多个参考序列中的一个参考序列的片段，其中，每个连续片段与所述参考序列之一的基因座索引对齐，并且所述连续片段的至少一部分在对齐的基因座索引处重叠，并且还包括多个质量值，每个质量值从质量值字母表导出并且被分配给连续片段之一的对应符号，其中，每个质量值指示对应连续片段中的对应符号正确的似然度，其中，该方法包括能够由数据处理系统执行的步骤：确定特定基因座索引处的质量值，质量值被分配给与所述特定基因座索引对齐的连续片段的符号；以及基于所确定的质量值计算特定基因座索引处的估计确定性，其中，所述估计确定性指示与对应符号相关的所确定的质量值中每个质量值的正确性的似然度；以及通过基于所计算的估计确定性将每个确定的质量值变换为变换后质量值来对所确定的质量值进行编码。 | ||
| 搜索关键词： | 连续片段 基因座 参考序列 对齐 索引处 确定性 数据结构 似然度 导出 索引 编码数据结构 数据处理系统 字母表 符号字母表 符号相关 符号序列 分配 | ||
【主权项】：
1.一种用于编码数据结构的质量值的方法，其中，所述数据结构包括多个连续片段，每个连续片段包括从符号字母表导出的符号序列并且对应于一个或多个参考序列中的一个参考序列的片段，其中，每个连续片段与所述参考序列之一的基因座索引对齐，并且所述连续片段的至少一部分在对齐的基因座索引处重叠，并且所述数据结构还包括多个质量值，每个质量值从质量值字母表导出并且被分配给所述连续片段之一的对应符号，其中，每个质量值指示对应连续片段中的所述对应符号正确的似然度，其中，所述方法包括能够由数据处理系统执行的步骤：确定特定基因座索引处的质量值，所述质量值被分配给与所述特定基因座索引对齐的连续片段的符号；基于所确定的质量值计算所述特定基因座索引处的估计确定性，其中，所述估计确定性指示与对应符号相关的所确定的质量值中每个质量值的正确性的似然度；以及通过基于所计算的估计确定性将每个确定的质量值变换为变换后质量值来对所确定的质量值进行编码。
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