[发明专利]一种去除测序数据噪声的方法有效
申请号: | 201710031232.7 | 申请日: | 2017-01-17 |
公开(公告)号: | CN106611107B | 公开(公告)日: | 2020-09-22 |
发明(设计)人: | 王演;张宁 | 申请(专利权)人: | 大连海事大学 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16B30/00 |
代理公司: | 大连东方专利代理有限责任公司 21212 | 代理人: | 张大保;李馨 |
地址: | 116026 辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: |
本发明公开了一种去除测序数据噪声的方法,包括以下步骤:S1:对原始RNA‑Seq数据进行过滤,应用最小过滤原则,去除原始数据矩阵中的数值为0或表达量极低的行;S2:对过滤后的数据进行标准化处理,去除系统偏差,将不同的结果根据全局数值进行调整,使个体之间的数据具有可比性;S3:计算标准化数据后感兴趣的变量和批次噪声之间的相关性,进行相关系数显著性检验,求出P值,若P0.05,则有显著相关性,否则没有显著相关性;S4:若两者相关,则对数据进行rlog变换;若两者不相关,则先对数据进行Z‑Score处理后,再log变换,Z‑Score的模型为: |
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搜索关键词: | 一种 去除 序数 噪声 方法 | ||
【主权项】:
一种去除测序数据噪声的方法,其特征在于,包括以下步骤:S1:对原始数据集进行过滤,应用最小过滤原则,去除原始数据矩阵中数值为0或表达量极低的行;S2:对过滤后的数据进行标准化处理,去除系统偏差,将不同的结果根据全局数值进行调整,使个体之间的数据具有可比性;S3:计算标准化数据后组变量和批次噪声之间的相关性,进行相关系数显著性检验,求出P值,若P<0.05,则有显著相关性,否则没有显著相关性;S4:若两者相关,则对数据进行rlog变换;若两:若两者不相关,则先对数据进行Z‑Score处理,然后对处理后的数据进行log变换,Z‑Score的模型为:X=Y-μν]]>其中:Y为处理前的数据,X为处理后的数据,μ为均值,ν为方差;S5:确定替代变量。
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