[发明专利]一种与杨树抗逆基因表达调控相关的内参基因的筛选方法

摘要

本发明公开了一种与杨树抗逆基因表达调控相关的内参基因的筛选方法，步骤包括选用编号为GSE13990，GSE15242，GSE21171和GSE23637的基因芯片，对基因芯片中的探针进行归一化处理，获得候选内参基因，再利用InterproScan软件进行功能预测，选择维持杨树生命基础功能的相关基因为内参基因。该筛选方法能够获得现有技术报道以外的新的内参基因，丰富了杨树内参基因的选择，为筛选出更稳定、更理想的内参基因提供了途径，对杨树抗逆相关基因的表达水平的研究，以及系统地进行杨树的抗逆性研究具有重要意义，对进一步选育抗逆优良植株具有重要的指导作用。

主权项

一种与杨树抗逆基因表达调控相关的内参基因的筛选，其特征在于，包括以下步骤：(1)收集与杨树抗逆基因表达调控相关的基因芯片，选择编号为GSE13990，GSE15242，GSE21171和GSE23637的基因芯片为特异性筛选芯片；(2)对步骤(1)的4个基因芯片中包含的探针进行归一化处理，步骤包括：步骤一：利用Expression Console软件中的MAS5算法计算得到基因芯片中每个探针的P‑Value值，筛选P‑Value值<0.05的探针；步骤二：利用Expression Console软件中的RMA算法计算筛选后的探针在不同胁迫条件下的CV值，将探针按照CV值从小到大的顺序进行排序；(3)选择步骤(2)中排序前50的探针所对应的杨树基因为候选基因，利用InterproScan软件对50个候选基因进行功能预测，选择维持杨树生命基础功能的相关基因为所述内参基因。