[发明专利]一种发现并整合直肠癌相关基因及其功能分析的系统

摘要

本发明公开了一种利用公共数据资源发现并整合直肠癌相关基因及其功能分析的方法及系统和应用。基于公共数据资源，合理运用开放性的大数据资源和多样的生物信息学分析手段，对mRNA表达数据进行分析处理，识别与复杂疾病相关的重要基因及其功能。包括：样本数据下载和整理；对基因表达数据的分析；筛选差异表达基因；对基因进行功能分析和蛋白互作分析。本发明能解决不擅长整合现有网络资源、不熟悉mRNA相关的最常用数据库及前沿分析方法以及不能独立完成mRNA表达谱相关的生物信息学分析等问题。能发现与直肠癌等复杂疾病相关的多个风险通路和基因，对复杂疾病的生物靶向治疗、生物药物研制、致病机理阐述及风险预测都有重要意义。

主权项

一种利用公共数据资源发现并整合直肠癌相关基因及其功能分析的方法，其特征在于：包括如下步骤：步骤1，样本数据下载和整理：获取基因表达数据，选定目标疾病直肠癌和测序平台，下载数据，下载的数据包含疾病样本和对应的正常样本；步骤2，对步骤1得到的基因表达数据去极值并分析；步骤3，对经过步骤2处理后的基因表达数据进行筛选差异表达分析基因；步骤4，对步骤3得到的基因进行功能分析并找出与疾病相关的条目；步骤5，互作基因分析，构建网络示意图。