[发明专利]一种筛选与已知菌株表型相似的菌株的方法有效
| 申请号： | 201710046099.2 | 申请日： | 2017-01-22 |
| 公开（公告）号： | CN108342447B | 公开（公告）日： | 2021-10-15 |
| 发明（设计）人： | 籍月彤 | 申请（专利权）人： | 中国科学院青岛生物能源与过程研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/04 | 分类号： | C12Q1/04;C12Q1/10;G01N21/65;C12R1/19 |
| 代理公司： | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人： | 肖艳;徐迅 |
| 地址： | 266101 山*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 一种筛选与已知菌株表型相似的菌株的方法，包括将待选菌株与已知菌株分别培养至相同生长时期；分别取样后去除培养基，用低拉曼背景溶液清洗菌株并重悬；将待选菌株和已知菌株分别点样到低拉曼背景的点样片上；分别对待选菌株和已知菌株进行单细胞随机选取并采集拉曼组信号，选取的单细胞个数不少于10个；采集单细胞旁边的背景信号，进行背景信号扣除；分别对待选菌株和已知菌株扣除背景信号后的单细胞拉曼组数据进行基线处理后，得到对应的待选菌株和已知菌株的单细胞拉曼组预处理结果；用统计学分析算法对单细胞拉曼组预处理结果进行相似性分析，待选菌株中与已知菌株的单细胞拉曼组相似程度大于85％为与已知菌株表型相似的菌株。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 筛选 已知 菌株 表型 相似 方法 | ||
【主权项】：
1.一种筛选与已知菌株表型相似的菌株的方法，其特征在于，包括如下步骤：1)将待选菌株与已知菌株分别培养至相同生长时期；2)分别取样后去除培养基，用低拉曼背景溶液清洗菌株并重悬；3)将待选菌株和已知菌株分别点样到低拉曼背景的点样片上；4)分别对待选菌株和已知菌株进行单细胞随机选取并采集拉曼组信号，选取的单细胞个数不少于10个；同时采集单细胞旁边的背景信号，进行背景信号扣除；5)分别对待选菌株和已知菌株扣除背景信号后的单细胞拉曼组数据进行基线处理后，得到对应的待选菌株和已知菌株的单细胞拉曼组预处理结果；6)用统计学分析算法对单细胞拉曼组预处理结果进行相似程度分析，待选菌株中与已知菌株的单细胞拉曼组相似程度大于85％的为与已知菌株表型相似的菌株。
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