[发明专利]一种利用普通牛Y染色体单核苷酸遗传标记鉴定公牛品种的方法

摘要

本发明公开了一种利用普通牛(Bos taurus)Y染色体单核苷酸遗传标记鉴定公牛品种的方法。本发明利用基因组重测序结果，对主要肉牛和奶牛品种的Y染色体DNA序列进行扫描，发现了荷斯坦牛、红安格斯牛、夏洛来牛、盖普威牛、利木赞牛、西门塔尔牛、韩牛、海福特牛品种特有的Y染色体SNP位点，根据这些SNP位点在DNA水平上鉴别不同品种公牛，能有效用于上述各品种的引种及分子标记辅助育种，为快速建立遗传资源优良的普通牛种群奠定基础。

主权项

一种利用普通牛Y染色体单核苷酸遗传标记鉴定公牛品种的方法，其特征在于：包括以下步骤：提取待鉴定公牛的基因组DNA，对该基因组DNA在牛Y染色体参考基因组序列中各个与品种鉴定关联的特征SNP所对应的单核苷酸位点的多态性进行遍历检测，若检测到突变等位基因，则根据检出突变等位基因的位点确定待鉴定公牛的品种；其中，所述公牛的品种选自荷斯坦牛、海福特牛、夏洛莱牛、红安格斯牛、盖普威牛、利木赞牛、西门塔尔牛及韩牛中的至少一种；所述荷斯坦牛的特征SNP分别为SNP1、SNP2、SNP3，SNP1、SNP2、SNP3分别定位在牛Y染色体参考基因组第9479545、42835264、10146565位，对应位的突变等位基因分别为碱基T、G、A；所述红安格斯牛的特征SNP为SNP4，SNP4定位在牛Y染色体参考基因组第42503008位，突变等位基因为碱基A；所述夏洛来牛的特征SNP分别为SNP5、SNP6，SNP5、SNP6分别定位在牛Y染色体参考基因组第6993048、42380924位，对应位的突变等位基因分别为碱基G、C；所述盖普威牛的特征SNP分别为SNP7、SNP8，SNP7、SNP8分别定位在牛Y染色体参考基因组第10598849、42508257位，对应位的突变等位基因均为碱基T；所述利木赞牛的特征SNP为SNP9，SNP9定位在牛Y染色体参考基因组第9053955位，突变等位基因为碱基A；所述西门塔尔牛的特征SNP为SNP10，SNP10定位在牛Y染色体参考基因组第7966557位，突变等位基因为碱基G；所述韩牛的特征SNP分别为SNP11、SNP12、SNP13、SNP14、SNP15，SNP11、SNP12、SNP13、SNP14、SNP15分别定位在牛Y染色体参考基因组第9315953、9483036、9317944、6651950、3752566位，对应位的突变等位基因分别为碱基T、A、G、C、C；所述海福特牛的特征SNP为SNP16，SNP16定位在牛Y染色体参考基因组第42405900位，突变等位基因为碱基A。