[发明专利]通过单细胞转录组测序进行细胞质量控制的方法有效
| 申请号： | 201710091004.9 | 申请日： | 2017-02-20 |
| 公开（公告）号： | CN106701995B | 公开（公告）日： | 2019-11-26 |
| 发明（设计）人： | 田埂;郎继东;张丽娜 | 申请（专利权）人： | 元码基因科技(北京)股份有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12Q1/02;G16B30/10 |
| 代理公司： | 11595 北京科石知识产权代理有限公司 | 代理人： | 高元吉<国际申请>=<国际公布>=<进入 |
| 地址： | 100102 北京市朝*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提供通过单细胞转录组测序进行细胞质量控制的方法。其包括单细胞分离步骤，以获得总的单细胞数；对每个单细胞进行转录组扩增的步骤，确认能够进行扩增但不足以达到对测序结果进行分析的单细胞数；测序及分析步骤，其中包括对测序结果进行主成分分析和聚类分析，并与标准单细胞数据库进行比较，计算偏离总趋势的单细胞数；筛选步骤，其中包括基于单细胞分型的筛选和基于表达基因类型的筛选，基于单细胞分型的筛选包括筛选活力水平大于75％的细胞，基于表达基因类型的筛选包括根据基因功能将表达基因分类为良性基因群、中性基因群和恶性基因群。本发明的方法可对细胞的均一性或同质性进行有效控制。 | ||
| 搜索关键词： | 通过 单细胞 转录 组测序 进行 细胞 质量 控制 方法 | ||
【主权项】：
1.一种通过单细胞转录组测序进行细胞质量控制的方法，其包括以下步骤：/n单细胞分离步骤，以获得总的单细胞数s；/n对每个所述单细胞进行转录组扩增的步骤，确认能够进行扩增但不足以达到对测序结果进行分析的单细胞数m；/n测序及分析步骤，其中包括对测序结果进行主成分分析和聚类分析，并与标准单细胞数据库进行比较，计算偏离总趋势的单细胞数n；/n筛选步骤，其中包括基于单细胞分型的筛选和基于表达基因类型的筛选，/n其中所述基于单细胞分型的筛选包括利用下式计算细胞活力水平，并筛选所述活力水平大于75％的细胞：/n细胞活力水平＝(n+m)/s×100％，/n其中所述基于表达基因类型的筛选包括根据基因功能将所述表达基因分类为良性基因群、中性基因群和恶性基因群。/n
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