[发明专利]一种以24-脱氢胆固醇还原酶(DHCR24)为靶点进行降胆固醇药物的虚拟筛选方法

摘要

本发明涉及一种以24‑脱氢胆固醇还原酶(DHCR24)为靶点进行降胆固醇药物的虚拟筛选方法。包括以下步骤：1)确定DHCR24的分子结构；2)采用分子对接软件，依据链甾醇与DHCR24对接后的结合口袋，确定药物小分子对接的活性中心，设定活性口袋；3)整理对接用小分子配体数据库；4)根据设定的活性口袋，利用分子对接软件，将对接用小分子配体数据库中的小分子配体与活性口袋依次进行对接；5)对初步对接筛选出的结果，进行精确对接，确定具有降胆固醇作用效果的候选药物。采用本发明可以在短时间内从现有小分子数据库中，获得具有DHCR24竞争性抑制作用，并开发为新型降胆固醇药物的小分子候选药物，大大提高研发效率，缩短新药研究周期。

主权项

1.一种以24‑脱氢胆固醇还原酶（DHCR24）为靶点进行降胆固醇药物的虚拟筛选方法，其特征在于：包括以下步骤：1）确定DHCR24的分子结构；2）对DHCR24进行前期处理和优化；采用分子对接软件，依据链甾醇与DHCR24对接后的结合构象，确定药物小分子对接的活性中心，设定活性口袋；具体为：3.1）将DHCR24与FAD进行对接；然后以此结构为基础，采用全局性搜索，对接链甾醇，根据autodock vina 打分结果，初步挑选打分高的结合构象；3.2）以初步挑选的打分高的结合构象为基础，采用autodock4半柔性对接方式，对结合构象进行再次精确对接，对对接后产生的不同结合构象的成簇情况进行综合分析，选择能量最低簇并且结合构象最为集中，且形成一个氢键的第一个构象作为最佳结合构象及活性中心，从而确定药物小分子的活性口袋；所述活性口袋为：中心坐标为x=72.194、y=51.111、z=24.361，网格大小为8×10×18，步长设置为1；4）整理对接用小分子配体数据库，并进行筛选，筛选项目为毒性筛选、类药性筛选；5）根据设定的活性口袋，利用分子对接软件，将对接用小分子配体数据库中的小分子配体与活性口袋依次进行对接；6）对初步对接筛选出的结果，进行精确对接，对药物小分子配体与活性口袋的相互作用方式，进行综合性评估，初步确定具有降胆固醇作用效果的药物。