[发明专利]5-醛基胞嘧啶的标记方法及其在单碱基分辨率测序中的应用有效

专利信息
申请号: 201710111600.9 申请日: 2017-02-28
公开(公告)号: CN106957350B 公开(公告)日: 2019-09-27
发明(设计)人: 伊成器;朱晨旭;夏波 申请(专利权)人: 北京大学
主分类号: C07H21/02 分类号: C07H21/02;C07H21/04;C07H1/00;C12Q1/6869
代理公司: 北京柏杉松知识产权代理事务所(普通合伙) 11413 代理人: 刘继富;王春伟
地址: 100871*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明提供了一种5‑醛基胞嘧啶的标记方法及其在单碱基分辨率测序中的应用,其中5‑醛基胞嘧啶的标记方法包括以下步骤:(1)准备DNA或RNA样品;(2)将DNA或RNA样品与缓冲溶液、化合物R1‑CH2‑CN混合,得到标记反应体系;并使其中的化合物R1‑CH2‑CN与DNA或RNA分子中的5‑醛基胞嘧啶反应,从而实现5‑醛基胞嘧啶的标记;反应过程如下:其中,R1为紧邻着CH2基团的吸电子基团,优选为‑CN、更优选为‑CN;R为与5‑醛基胞嘧啶连接的DNA或RNA分子:所述标记反应体系的pH值为7.5‑9。基于此,本发明还提供了5‑醛基胞嘧啶测序分析方法,其可以在单细胞水平上进行,并实现单碱基分辨率水平的测序。
搜索关键词: 胞嘧啶 标记 方法 及其 碱基 分辨率 中的 应用
【主权项】:
1.一种5‑醛基胞嘧啶的标记方法,其中所述方法包括以下步骤:(1)准备DNA或RNA样品;(2)将DNA或RNA样品与缓冲溶液、化合物R1‑CH2‑CN混合,得到标记反应体系;并使其中的化合物R1‑CH2‑CN与DNA或RNA分子中的5‑醛基胞嘧啶反应,从而实现5‑醛基胞嘧啶的标记;反应过程如下:其中,R1为紧邻着CH2基团的吸电子基团;R为与5‑醛基胞嘧啶连接的DNA或RNA分子:所述标记反应体系的pH值为7.5‑9;化合物R1‑CH2‑CN在所述标记反应体系中的浓度为75‑1500mM。
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