[发明专利]一种基因测序数据压缩和传输方法在审
| 申请号： | 201710140073.4 | 申请日： | 2017-03-10 |
| 公开（公告）号： | CN106971090A | 公开（公告）日： | 2017-07-21 |
| 发明（设计）人： | 左褀洋;唐元华;徐健 | 申请（专利权）人： | 首度生物科技（苏州）有限公司;苏州首度基因科技有限责任公司 |
| 主分类号： | G06F19/20 | 分类号： | G06F19/20;G06F19/28;G06F17/30 |
| 代理公司： | 北京恒泰铭睿知识产权代理有限公司11642 | 代理人： | 苏天功 |
| 地址： | 215123 江苏省苏州市苏州*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 一种基因测序数据压缩和传输方法，包括以下步骤A.建立标准DNA序列数据库将标准DNA序列数据库部署到数据处理设备；C.DNA测序数据的预处理将DNA测序数据逐一与标准DNA数据库比对，生成对应关系，将标准DNA数据库编号替换DNA测序数据原文,将DNA测序数据与标准DNA数据库差异的部分单独存储；D.压缩；E.存储或传输。由于标准DNA序列数据库保存在数据处理设备中，因此，DNA测序数据中包含的大量信息可以通过标准DNA序列数据库的编号表示，因此，经过DNA测序数据的预处理步骤后的数据容量大大降低，再经过进一步压缩，容量更小，是的DNA测序数据的存储空间更小，数据传输效率更高，与第二代测序技术甚至是第三代测序技术的产出数据相匹配。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基因 序数 压缩 传输 方法 | ||
【主权项】：
一种基因测序数据压缩方法，其特征在于:包括以下步骤A. 建立标准DNA序列数据库：将标准DNA序列数据库部署到数据处理设备；C. DNA测序数据的预处理：将DNA测序数据逐一与标准DNA数据库比对，生成对应关系，将标准DNA数据库编号替换DNA测序数据原文, 将DNA测序数据与标准DNA数据库差异的部分单独存储；D. 压缩：将预处理后的DNA测序数据进行压缩形成压缩文件；E. 将压缩文件进行存储或传输。
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G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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