[发明专利]一种Y单倍群检测方法有效
申请号: | 201710203496.6 | 申请日: | 2017-03-30 |
公开(公告)号: | CN107153776B | 公开(公告)日: | 2020-05-12 |
发明(设计)人: | 姚笑天;王传超;唐森威;陈钢;郑强 | 申请(专利权)人: | 深圳市早知道科技有限公司 |
主分类号: | G16B20/30 | 分类号: | G16B20/30 |
代理公司: | 深圳市瑞方达知识产权事务所(普通合伙) 44314 | 代理人: | 张秋红;高瑞 |
地址: | 518042 广东省深圳市福*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明涉及一种Y单倍群检测方法,包括以下步骤:获取用于参照的Y单倍群树的参照Y单倍群树信息,其中,参照Y单倍群树信息包括Y单倍群树中每个参照单倍群的参照单倍群信息;将每个参照单倍群信息与测试SNP信息进行匹配,得到至少一个满足预设条件的目标参照单倍群;根据目标参照单倍群的参照单倍群坐标信息,获取与目标参照单倍群相关的第一数值与第二数值,并对每个目标参照单倍群进行评分,输出评分最高的目标参照单倍群所对应的结果信息。本发明实施例通过将参照单倍群与测试单倍群进行比对,基于从根节点出发到目标单倍群的路径的评分系统,可以同时适用二代测序结果和高通量micro array的SNP分型结果,检测适用性更高,提高检测手段的应用广泛度。 | ||
搜索关键词: | 一种 单倍群 检测 方法 | ||
【主权项】:
一种Y单倍群检测方法,其特征在于,包括以下步骤:获取用于参照的Y单倍群树的参照Y单倍群树信息,其中,所述参照Y单倍群树信息包括所述Y单倍群树中每个参照单倍群的参照单倍群信息,所述参照单倍群信息包括参照单倍群坐标信息;将所述每个参照单倍群的参照单倍群信息与每个测试SNP的测试SNP信息进行匹配,得到至少一个满足预设条件的目标参照单倍群;根据所述目标参照单倍群的参照单倍群坐标信息,获取与所述目标参照单倍群相关的第一数值与第二数值,其中,所述第一数值为从所述目标参照单倍群到与所述目标参照单倍群对应的根节点单倍群之间路径上的其他目标参照单倍群数量,所述第二数值为所述其他目标参照单倍群数量与在所述路径上总的有效单倍群数量的比值;根据所述第一数值与第二数值对每个所述目标参照单倍群进行评分,输出评分最高的目标参照单倍群所对应的结果信息。
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