[发明专利]基于癌症基因组和非特异性基因标签的药物重定位方法有效

专利信息
申请号: 201710208722.X 申请日: 2017-03-31
公开(公告)号: CN108664769B 公开(公告)日: 2021-09-21
发明(设计)人: 韩敬东;徐迟 申请(专利权)人: 中国科学院上海营养与健康研究所
主分类号: G16B30/20 分类号: G16B30/20;G16B20/50;G16B50/00
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 31100 代理人: 陈静
地址: 200031 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明涉及基于癌症基因组和非特异性基因标签的大规模药物重定位方法。本发明首次揭示一种通过整合分析大规模、不同癌症类型的转录组数据,来提取无组织来源背景的单个人类编码基因突变的表达谱核心标签的方法。基于核心标签,本发明首次提供了针对人体内环境的、非以往基于模式动物或细胞的、可以全面覆盖8,000多个人类基因组潜在药物靶基因的药物重定位方法,并首次设计了衡量药物‑靶基因相互作用特异性的定量指标,从而实现了大规模全面分析人类药物靶基因的药物重定位分析方法,为药物靶点设计和人类疾病的治疗提供新的途径。
搜索关键词: 基于 癌症 基因组 非特 异性 基因 标签 药物 定位 方法
【主权项】:
1.一种基于多种癌症类型转录组数据整合分析、来构建无组织来源背景的单个人类编码基因突变的表达谱核心标签的方法,其特征在于,该方法包括:(1)以癌症转录组数据库为基础,在多种癌症类型中分别获取基因Gx的各种基因突变类型的表达谱标签;在每一癌症类型中的该基因Gx的各种突变类型,定义为该基因的不同表达谱核心标签;获得该基因的所有突变类型的表达谱核心标签合集;(2)对于(1)定义的表达谱核心标签合集,消除组织来源背景;(3)对于(2)的表达谱核心标签合集,移除癌症的背景效应;(4)排除非单基因突变的核心标签,使得每个表达谱核心标签代表单个基因的突变,以获得该基因的基因突变的表达谱核心标签;(5)依次变换基因Gx,重复步骤(1)~(4),提取n种基因的基因突变的表达谱核心标签。
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