[发明专利]基于UPLC‑QTOF的植物差异性代谢物快速筛选方法有效

专利信息
申请号: 201710249414.1 申请日: 2017-04-17
公开(公告)号: CN106841494B 公开(公告)日: 2018-03-20
发明(设计)人: 于永杰;付海燕;佘远斌 申请(专利权)人: 宁夏医科大学
主分类号: G01N30/88 分类号: G01N30/88
代理公司: 宁夏合天律师事务所64103 代理人: 杨丽坤,孙彦虎
地址: 750003 宁夏回族*** 国省代码: 宁夏;64
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摘要: 发明提供的基于UPLC‑QTOF的植物差异性代谢物快速筛选方法,该方法利用UPLC‑QTOF现代分析技术获得植物中物质化学组分信息,随后利用非靶标代谢轮廓分析技术对物质信息进行提取,采用对色谱峰进行提取和源内裂解分子碎片聚类后,采用动态规划方法进行样本间的时间漂移校正,随后根据自适应网络链接法对样本间的物质进行注册,最后采用统计分析筛选出植物样本间的差异性代谢产物。
搜索关键词: 基于 uplc qtof 植物 差异性 代谢物 快速 筛选 方法
【主权项】:
一种基于UPLC‑QTOF的植物差异性代谢物快速筛选方法,分析同一物种不同来源的至少两个样本,其特征在于,包括以下步骤:时间漂移校正:每一个样本分别得到一个该样本所有色谱峰的高精度质谱表征,选择一个样本作为参比,利用动态规划算法进行其它样本相对参比的时间漂移校正,即对于其它样本的每一个色谱峰,都根据其保留时间和质谱精度与参比相比较进行校正,时间漂移的阈值设定为2min,质谱精度误差设定100ppm,使得不同样本中对应于同一个物质的色谱峰保留时间较为接近,接着使用自适应网络链接算法对不同样本间对应于同一个物质的色谱峰进行注册,最终使得不同样本中属于同一个物质的色谱峰对齐;使用自适应网络链接算法对不同样本间对应于同一个物质的色谱峰进行注册的具体步骤如下:寻找侯选峰:选择一个当前色谱峰,将其他样本中与选择的当前色谱峰不在同一个链接线上,且距离最近的色谱峰定义为侯选峰;链接两个峰:若其他样本中与侯选峰不在同一个链接线上,且距离最近的色谱峰是当前色谱峰,则链接两个峰,即将当前色谱峰和侯选峰可视作不同样本中对应于同一个物质的色谱峰;若其他样本中与侯选峰不在同一个链接线上,且距离最近的色谱峰不是当前色谱峰,则不链接两个峰;链接的过程引入一个约束,即一个样本不能出现两个色谱峰对应同一个物质,且属于同一个物质的质谱精度误差为100ppm;重复操作:重复寻找侯选峰至链接两个峰步骤,直到链接线无法更新时,停止重复;方差分析建模:接着利用方差分析分析所有样本中属于同一个物质的色谱峰,筛选不同样本之间具有差异性的指标,利用PLS‑DA模型计算各自在建模过程中的VIP值,最终选择VIP大于1,且置信水平小于0.05的变量作为潜在的能够表征样本间差异的差异性代谢物。
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