[发明专利]一种新的分析生物基因组拷贝数变异的可视化方法

摘要

本发明公开了一种新的分析生物基因组拷贝数变异的可视化方法，把每个染色体的所有基因，按照每个基因的ucstart位置作为横坐标，该基因对应的所有样本拷贝数的均值或者中位数作为纵轴，然后用MATLAB绘制散点，一种颜色表示一种癌症。如果要对比多种癌症类型，我们根据颜色就可以很清楚的知道是哪种癌症类型，它们之间的比较可视化效果最佳。如果要对比同一种癌症类型下的肿瘤样本和正常样本，肿瘤样本表示成一种颜色，正常样本表示成另外一种颜色，它们之间的比较可视化效果也是最佳的。相比之前的可视化方法，我们用的这种可视化方法，可以很清晰明了的对比不同的癌症类型的拷贝数变异或者在同一个癌症类型下不同类型样本的拷贝数变异对比。

主权项

一种新的分析生物基因组拷贝数变异的可视化方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)横纵坐标的确定：人体有22条常染色体，基因约含3万多个基因，每个基因都有具体对应的几号染色体和对应的具体的起始位置，把每个染色体的所有基因，按照每个基因的起始位置作为横坐标，用matlab软件中的均值函数或者中位数函数遍历该基因对应的所有样本拷贝数，将该基因的均值或者中位数值作为纵坐标；(2)绘图：用matlab中的plot函数，绘制点；由于每条染色体上的基因个数很多，所有绘制出的结果是点很密；(3)生物中每条染色体的着丝粒都有具体的位置坐标，用matlab中的line函数，用黑色的竖杠将着丝粒表示出来，同时将染色体p臂，q臂上的基因分隔开来。