[发明专利]用于食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的SNP标记及其应用有效

专利信息
申请号: 201710278371.X 申请日: 2017-04-25
公开(公告)号: CN107012231B 公开(公告)日: 2019-10-18
发明(设计)人: 杜红丽;蒙裕欢;曾玉琳 申请(专利权)人: 华南理工大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 代理人: 崔红丽
地址: 510640 广*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开一种用于食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的SNP标记及其应用。该SNP标记包括48个SNP位点,为SNP1~SNP48,并分别表示其位于SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:48所示的核苷酸序列的第151位。本发明采用生物信息技术的优势开发出能用于食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的SNP标记,对于评估食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入水平,SNP标记的应用可大大降低成本和简化操作。SNP标记应用可达到快速初筛和降低检测成本的目的,从而促进食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的标准化进程。
搜索关键词: 遗传背景 恒河猴 食蟹猴 渗入 评估 应用 生物信息技术 标准化进程 核苷酸序列 初筛 检测 开发
【主权项】:
1.一种用于食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的SNP标记,其特征在于:所述的SNP标记包括48个SNP位点,为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8、SNP9、SNP10、SNP11、SNP12、SNP13、SNP14、SNP15、SNP16、SNP17、SNP18、SNP19、SNP20、SNP21、SNP22、SNP23、SNP24、SNP25、SNP26、SNP27、SNP28、SNP29、SNP30、SNP31、SNP32、SNP33、SNP34、SNP35、SNP36、SNP37、SNP38、SNP39、SNP40、SNP41、SNP42、SNP43、SNP44、SNP45、SNP46、SNP47、SNP48;所述的SNP1表示该SNP位点位于SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP2表示该SNP位点位于SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;所述的SNP3表示该SNP位点位于SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W;所述的SNP4表示该SNP位点位于SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP5表示该SNP位点位于SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP6表示该SNP位点位于SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP7表示该SNP位点位于SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S;所述的SNP8表示该SNP位点位于SEQ ID NO:8所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;所述的SNP9表示该SNP位点位于SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP10表示该SNP位点位于SEQ ID NO:10所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP11表示该SNP位点位于SEQ ID NO:11所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K;所述的SNP12表示该SNP位点位于SEQ ID NO:12所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S;所述的SNP13表示该SNP位点位于SEQ ID NO:13所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K;所述的SNP14表示该SNP位点位于SEQ ID NO:14所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP15表示该SNP位点位于SEQ ID NO:15所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;所述的SNP16表示该SNP位点位于SEQ ID NO:16所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP17表示该SNP位点位于SEQ ID NO:17所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S;所述的SNP18表示该SNP位点位于SEQ ID NO:18所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP19表示该SNP位点位于SEQ ID NO:19所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基M;所述的SNP20表示该SNP位点位于SEQ ID NO:20所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W;所述的SNP21表示该SNP位点位于SEQ ID NO:21所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;所述的SNP22表示该SNP位点位于SEQ ID NO:22所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP23表示该SNP位点位于SEQ ID NO:23所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;所述的SNP24表示该SNP位点位于SEQ ID NO:24所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP25表示该SNP位点位于SEQ ID NO:25所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K;所述的SNP26表示该SNP位点位于SEQ ID NO:26所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;所述的SNP27表示该SNP位点位于SEQ ID NO:27所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S;所述的SNP28表示该SNP位点位于SEQ ID NO:28所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP29表示该SNP位点位于SEQ ID NO:29所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;所述的SNP30表示该SNP位点位于SEQ ID NO:30所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;所述的SNP31表示该SNP位点位于SEQ ID NO:31所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP32表示该SNP位点位于SEQ ID NO:32所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP33表示该SNP位点位于SEQ ID NO:33所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;所述的SNP34表示该SNP位点位于SEQ ID NO:34所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;所述的SNP35表示该SNP位点位于SEQ ID NO:35所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S;所述的SNP36表示该SNP位点位于SEQ ID NO:36所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP37表示该SNP位点位于SEQ ID NO:37所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP38表示该SNP位点位于SEQ ID NO:38所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S;所述的SNP39表示该SNP位点位于SEQ ID NO:39所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;所述的SNP40表示该SNP位点位于SEQ ID NO:40所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W;所述的SNP41表示该SNP位点位于SEQ ID NO:41所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP42表示该SNP位点位于SEQ ID NO:42所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP43表示该SNP位点位于SEQ ID NO:43所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;所述的SNP44表示该SNP位点位于SEQ ID NO:44所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S;所述的SNP45表示该SNP位点位于SEQ ID NO:45所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;所述的SNP46表示该SNP位点位于SEQ ID NO:46所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K;所述的SNP47表示该SNP位点位于SEQ ID NO:47所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;所述的SNP48表示该SNP位点位于SEQ ID NO:48所示的核苷酸序列的第151位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R。
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