[发明专利]一种鉴定玉米籽粒性状的方法及其专用试剂盒

摘要

本发明公开了一种鉴定玉米籽粒性状的方法及其专用试剂盒。该试剂盒包括检测待测玉米的单倍型为单倍型HapI、单倍型HapII、单倍型HapⅢ还是单倍型HapⅣ的物质；籽粒性状为籽粒粒长和/或籽粒粒宽和/或籽粒粒长/籽粒粒宽。四个单倍型是基于SNP S‑1830和Indel S‑1558的基因型进行分型的。SNP S‑1830为玉米基因组中引物F和引物R组成的引物对的靶序列自5’末端起第189位核苷酸；引物F和物R的核苷酸序列依次见序列5和序列6。Indel S‑1558为玉米基因组具有9个串联重复的2bp序列、9个串联重复的2bp序列的缺失型Ⅰ或9个串联重复的2bp序列的缺失型Ⅱ。该试剂盒在玉米分子育种具有重要的应用价值。

主权项

1.A1)或A2)或A3)：A1)一种鉴定玉米籽粒粒长的方法，包括如下步骤：检测待测玉米的单倍型为单倍型HapI、单倍型HapII、单倍型HapⅢ还是单倍型HapⅣ，单倍型HapII的玉米的籽粒粒长>单倍型HapⅣ的玉米的籽粒粒长>单倍型HapⅢ的玉米的籽粒粒长>单倍型HapI的玉米的籽粒粒长；A2)一种鉴定玉米籽粒粒宽的方法，包括如下步骤：检测待测玉米的单倍型为单倍型HapI、单倍型HapII、单倍型HapⅢ还是单倍型HapⅣ，单倍型HapI的玉米的籽粒粒宽>单倍型HapII的玉米的籽粒粒宽>单倍型HapⅣ的玉米的籽粒粒宽>单倍型HapⅢ的玉米的籽粒粒宽；A3)一种鉴定玉米籽粒粒形的方法，包括如下步骤：检测待测玉米的单倍型为单倍型HapI、单倍型HapII、单倍型HapⅢ还是单倍型HapⅣ，单倍型HapⅢ的玉米的籽粒粒形>单倍型HapII的玉米的籽粒粒形>单倍型HapⅣ的玉米的籽粒粒形>单倍型HapI的玉米的籽粒粒形；所述籽粒粒形为籽粒粒长/籽粒粒宽；所述单倍型HapI的玉米为基于SNP S‑1830的基因型为AA纯合型且具有“9个串联重复的2bp序列的缺失型Ⅱ”的玉米；所述单倍型HapII的玉米为基于SNP S‑1830的基因型为GG纯合型且具有“9个串联重复的2bp序列”的玉米；所述单倍型HapⅢ的玉米为基于SNP S‑1830的基因型为GG纯合型且具有“9个串联重复的2bp序列的缺失型Ⅰ”的玉米；所述单倍型HapⅣ的玉米为基于SNP S‑1830的基因型为GG纯合型且具有“9个串联重复的2bp序列的缺失型Ⅱ”的玉米；所述SNP S‑1830为玉米基因组中引物F和引物R组成的引物对的靶序列自5’末端起第189位核苷酸；所述引物F为如下a1)或a2)：a1)序列表的序列5所示的单链DNA分子；a2)将序列5经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列5具有相同功能的DNA分子；所述引物R为如下a3)或a4)：a3)序列表的序列6所示的单链DNA分子；a4)将序列6经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列6具有相同功能的DNA分子；所述“9个串联重复的2bp序列”如序列表中序列7所示；所述“9个串联重复的2bp序列的缺失型Ⅰ”为所述“9个串联重复的2bp序列”缺失了第1个和第2个核苷酸；所述“9个串联重复的2bp序列的缺失型Ⅱ”为所述“9个串联重复的2bp序列”缺失了第1至4个核苷酸。