[发明专利]一种标准序列的验证方法、装置及其应用在审
申请号: | 201710344471.8 | 申请日: | 2017-05-16 |
公开(公告)号: | CN108866173A | 公开(公告)日: | 2018-11-23 |
发明(设计)人: | 邓天全;高强;杨林峰;贺丽娟;王娟 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因科技服务有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12M1/00;C12M1/34;G06F19/28 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 彭愿洁;彭家恩 |
地址: | 518083 广东省深圳市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本申请公开了一种标准序列的验证方法及装置,还公开了一种基因组组装序列的评估方法及装置。本申请提供的标准序列的验证方法,其标准序列中包含样品DNA的片段,其验证方法包括:获取reads数据库,该reads数据库通过将样品DNA片段化处理后构建测序文库并测序得到。将标准序列与上述reads数据库进行比对,计算标准序列的准确度。本申请的有益效果在于:通过将样品DNA测序的得到的reads数据库与标准序列进行对比,即对标准序列进行辅助验证,根据比对结果过滤掉有误的标准序列,确保了用于验证基因组组装序列的标准序列的准确性,进而提高了利用标准序列对基因组组装序列的评估效率。 | ||
搜索关键词: | 标准序列 验证 样品DNA 基因组 数据库 组装 测序 申请 比对结果 测序文库 准确度 片段化 比对 构建 评估 过滤 应用 | ||
【主权项】:
1.一种标准序列的验证方法,所述标准序列中包含样品DNA的片段,该验证方法包括:获取reads数据库,所述reads数据库通过将样品DNA片段化处理后构建测序文库并测序得到;将标准序列与所述reads数据库进行比对,计算标准序列的准确度。
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