[发明专利]凡纳滨对虾Na,K-ATPaseα亚基基因及SNP标记筛查的扩增引物和方法有效

专利信息
申请号: 201710370128.0 申请日: 2017-05-23
公开(公告)号: CN106978426B 公开(公告)日: 2020-09-01
发明(设计)人: 任春华;江晓;陈廷;黄文;胡超群 申请(专利权)人: 中国科学院南海海洋研究所
主分类号: C12N15/55 分类号: C12N15/55;C12N15/10;C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 代理人: 刘明星
地址: 511458 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开了凡纳滨对虾Na,K‑ATPaseα亚基基因及SNP标记筛查的扩增引物和方法。本发明针对凡纳滨对虾Na,K‑ATPaseα亚基的完整mRNA序列设计12对引物,通过PCR扩增、测序及序列拼接,获得凡纳滨对虾Na,K‑ATPaseα亚基的完整基因序列。针对所获得的序列分段设计引物,然后进行SNP位点筛查,共获得78个SNP位点。本发明建立了凡纳滨对虾Na,K‑ATPaseα亚基基因SNP标记开发的技术体系,为进一步筛选与凡纳滨对虾盐度抗逆相关的SNP标记和开发用于凡纳滨对虾亲子鉴定的分子标记奠定基础,从而加快凡纳滨对虾抗逆优良品种的选育进程。
搜索关键词: 凡纳滨 对虾 na atpase 基因 snp 标记 扩增 引物 方法
【主权项】:
一种凡纳滨对虾Na,K‑ATPaseα亚基基因扩增引物,其特征在于,包括12对扩增引物:引物对1:GLvNK‑F1:5’‑CACAGACGGTGAAGAATG‑3’;GLvNK‑R1:5’‑TGGGACCTTGTGCTCATC‑3’;引物对2:GLvNK‑F2:5’‑TGGAACTTGATGAGCACAA‑3’;GLvNK‑R2:5’‑GGCAATGAAGCAGAGGATA‑3’;引物对3:GLvNK‑F3:5’‑CTCCTGCTGTGGATTGGC‑3’;GLvNK‑R3:5’‑ATGAGAAGACGCCTGTGA‑3’;引物对4:GLvNK‑F4:5’‑GGAGCCCAACAAGGACAA‑3’;GLvNK‑R4:5’‑GACAGCATTGGTGGAGAA‑3’;引物对5:GLvNK‑F5:5’‑TTCTCCACCAATGCTGTC‑3’;GLvNK‑R5:5’‑GGCTACAATGATACCAATGAG‑3’;引物对6:GLvNK‑F6:5’‑TGTTGTGTTCCTCATTGGT‑3’;GLvNK‑R6:5’‑CAGTCTCGTGGATGGATAC‑3’;引物对7:GLvNK‑F7:5’‑CAAGTATCCATCCACGAGA‑3’;GLvNK‑R7:5’‑AGCCTTTGCTTCAGTGGG‑3’;引物对8:GLvNK‑F8:5’‑ATTCCCATCAAGGAGGTT‑3’;GLvNK‑R8:5’‑GGATGTTAGATGTCAGGGT‑3’;引物对9:GLvNK‑F9:5’‑CCTGACATCTAACATCCCTGAG‑3’;GLvNK‑R9:5’‑GCTTGTCGGTGAATGGGT‑3’;引物对10:GLvNK‑F10:5’‑CCTGCCATTTCCCTTGCC‑3’;GLvNK‑R10:5’‑CGCTCACGGAGACCAAAG‑3’;引物对11:GLvNK‑F11:5’‑ATCATGGCTGAGAACGGCTTCC‑3’;GLvNK‑R11:5’‑TGGAGAACGGAAGAGCAG‑3’;引物对12:GLvNK‑F12:5’‑TTCCGTTCTCCATCCTTA‑3’;GLvNK‑R12:5’‑ATGGAGCAGTAGTTGACC‑3’。
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