[发明专利]一种花生寡核苷酸探针及其设计方法和使用方法

摘要

本发明公开了一种花生寡核苷酸探针及其设计方法和使用方法，所述的寡核苷酸探针共有八种，为SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.8所示的核苷酸序列。本发明利用微卫星和端粒序列开发寡核苷酸探针，并利用新开发的寡核苷酸探针组配探针套，构建花生栽培种及野生种寡核苷酸核型，目的是建立经济高效且通用性强的花生细胞学标记设计技术与染色体识别技术，丰富花生染色体标记，识别花生栽培种与野生种基因组及其染色体，鉴定花生野生种染色体结构变异。本发明利用高通量小数据量简化测序(只测基因组4Gb数据量)和生物信息学分析，成功开发了花生寡核苷酸探针标记，为低成本高效率开发花生细胞学标记建立了一种新的有效方法。

主权项

一种花生寡核苷酸探针，其特征在于，所述的寡核苷酸探针共有八种，具体为：探针Oligo DP‑1：TAMARA‑5′‑TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCGTC AGAACTCTGAAGTTAAGCGTG‑3′；探针Oligo DP‑2：FAM‑5′‑ACTACTACTACTACTACTACTACTACTACT‑3′；探针Oligo DP‑3：FAM‑5′‑CATTAAATCAGTTATAGTTTGTTTGATGGTA‑3′；或TAMARA‑5′‑CATTAAATCAGTTATAGTTTGTTTGATGGTA‑3′；探针Oligo DP‑4：TAMARA‑5′‑ATTATTATTATTATTATTATTATTATTATT‑3′；探针Oligo DP‑5：FAM‑5′‑TTTAGGGTTTAGGGTTTAGGGTTTAGGGTTTAGGGTTTAG GGTTTAGGGTTTAGGG‑3′；探针Oligo DP‑6：TAMARA‑5′‑AAAAAATCGGAGGAGCCTGCCGAAGATGAGG‑3′；探针Oligo DP‑7：FAM‑5′‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA‑3′；或TAMARA‑5′‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA‑3′；探针Oligo DP‑8：FAM‑5′‑TGAAAACTTTTTATTTTTAAATTTTGAAACT‑3′。