[发明专利]一种利用全基因组数据挖掘甲基化模式的方法

摘要

本发明属于生物信息学的数据处理技术领域，公开了一种利用全基因组数据挖掘甲基化模式的方法，包括在多种数据样本集上使用基因芯片显著性分析SAM方法，分别筛选出全基因组上的差异甲基化位点；将多个样本集的甲基化差异位点取交集，得到共同差异位点集合；计算差异甲基化位点的甲基化水平与相应基因表达水平间的皮尔森相关系数，识别甲基化调控位点；对差异位点集合迭代进行AP聚类，得到甲基化簇，分别对每个甲基化簇进行模式分析，并通过基因注释和KEGG富集分析进行论证。本发明为针对去甲基化的药物研制提供参考和借鉴；不同类型的疾病在甲基化模式上的确存在共性，从全基因组角度研究甲基化模式与疾病的关系具有现实和临床意义。

主权项

一种利用全基因组数据挖掘甲基化模式的方法，其特征在于，所述利用全基因组数据挖掘甲基化模式的方法包括：在多种数据样本集上使用基因芯片显著性分析SAM方法，分别筛选出全基因组上的差异甲基化位点；将多个样本集的甲基化差异位点取交集，得到共同差异位点集合；计算差异甲基化位点的甲基化水平与相应基因表达水平间的皮尔森相关系数，识别甲基化调控位点；对差异位点集合迭代进行AP聚类，得到甲基化簇，分别对每个甲基化簇进行模式分析，并通过基因注释和KEGG富集分析进行论证。