[发明专利]自适应小动物脑功能磁共振成像数据分析方法有效
申请号: | 201710554895.7 | 申请日: | 2017-07-10 |
公开(公告)号: | CN107689057B | 公开(公告)日: | 2019-10-29 |
发明(设计)人: | 聂彬彬;王杰;叶松涛;刘华;单保慈 | 申请(专利权)人: | 中国科学院高能物理研究所 |
主分类号: | G06T7/33 | 分类号: | G06T7/33;G01R33/58 |
代理公司: | 北京志霖恒远知识产权代理事务所(普通合伙) 11435 | 代理人: | 郭栋梁 |
地址: | 100049 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本申请公开了一种自适应小动物脑功能磁共振成像数据分析方法,包括以下步骤:多次获取每只被试动物的全脑扫描图像,进行头动校正并获得各动物的全脑平均图像;以某一只动物全脑图像为参考图像,迭代的进行图像配准及图像平均,获得自适应脑模板;使用多通道高斯滤波的方式提取出自适应脑模板的脑内像素作为初始的脑内像素掩膜图像;获取与自适应脑模板空间匹配的脑内像素掩膜图像;将所有被试个体脑图像与自适应脑模板进行空间标准化,并进行颅骨剥离;获取所有被试动物的所有感兴趣区的时间序列;通过皮尔逊相关算法,获得所有感兴趣区两两之间的相关系数,已得被试动物的全脑网络。上述方案适应性广,效率高,且不受人为主观因素的影响。 | ||
搜索关键词: | 自适应 动物 功能 磁共振 成像 数据 分析 方法 | ||
【主权项】:
1.一种自适应小动物脑功能磁共振成像数据分析方法,其特征在于,包括以下步骤:S100:多次获取每只被试动物的全脑扫描图像,并将每只所述被试动物的每次所述全脑扫描图像进行时间片校正,以消除数据采集周期内各扫描层的时间偏差;S200:以每只所述被试动物成像时间序列中的第一个全脑扫描图像为头动校正参考图像,分别以每只所述被试动物的头动校正参考图像为参考,对该只所述被试动物的剩余各全脑扫描图像分别进行刚体变换以获得头动校正图像,对每只被试动物的所述头动校正参考图像及所述头动校正图像进行平均,获得每只被试动物的平均图像;S300:对所述平均图像迭代的进行图像配准及图像平均,获得用户数据驱动的自适应脑模板;S400:以所述自适应脑模板为参考标准,将所述每只被试动物的平均图像与所述参考标准进行图像配准,并将相同的配准参数应用于所述头动校正图像,以完成每只所述被试动物的空间标准化;S500:使用多通道高斯滤波的方式提取出所述自适应脑模板的脑内像素作为初始的脑内像素掩膜图像;S600:以标准脑图谱所提供的脑轮廓信息为先验知识,通过图像形态学算法及统一化分割的方法对初始的脑内像素掩膜图像进行边缘修正,获得最终的与自适应脑模板空间统一的颅内像素掩膜图像;S700:以所述颅内像素掩膜图像,去除自适应脑模板中的脑外像素,获得仅包含颅内信息的标准自适应脑模板;S800:将标准自适应脑模板与标准脑图谱进行配准,根据标准脑图谱中的感兴趣区的信息,获取所有被试动物的所有感兴趣区的时间序列;S900:通过皮尔逊相关算法,计算被试动物的所有感兴趣区两两之间的相关系数,获得所有被试动物的全脑网络。
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