[发明专利]一种二代和三代序列联合组装结果去冗余的方法和装置有效
| 申请号： | 201710606833.6 | 申请日： | 2017-07-24 |
| 公开（公告）号： | CN110021359B | 公开（公告）日： | 2021-05-04 |
| 发明（设计）人： | 邓天全;高强;杨林峰 | 申请（专利权）人： | 深圳华大基因科技服务有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/20 | 分类号： | G16B30/20 |
| 代理公司： | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人： | 潘登 |
| 地址： | 518083 广东省深圳市*** | 国省代码： | 广东;44 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明提供一种二代序列和三代序列联合组装结果去冗余的方法和装置，所述方法包括如下步骤：(1)根据基因组组装结果，划分和获取短序列和长序列；(2)将所述短序列和长序列进行比对，获得比对结果；(3)整合短序列比对结果，获得冗余序列；(4)去除冗余序列，获得组装结果。本发明方法和装置用于克服现有技术冗余序列去除不完全，基因组组装结果不完整、不准确的缺点，能够很好的去除二代和三代联合组装结果中的冗余序列，并能通过去除长度比较小的Scaffold，从而大幅提升Scaffold N90和contig N50的组装指标，同时也能提高基因组组装指标和准确性。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 二代 序列 联合 组装 结果 冗余 方法 装置 | ||
【主权项】：
1.一种二代序列和三代序列联合组装结果去冗余的方法，其特征在于，包括如下步骤：(1)根据基因组组装结果，划分和获取短序列和长序列；(2)将所述短系列和长序列进行比对，获得比对结果；(3)整合短序列比对结果，获得冗余序列；(4)去除冗余序列，获得组装结果。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于深圳华大基因科技服务有限公司，未经深圳华大基因科技服务有限公司许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201710606833.6/，转载请声明来源钻瓜专利网。
