[发明专利]一种基于免疫算法的密码子优化方法有效

专利信息
申请号: 201710611752.5 申请日: 2017-07-25
公开(公告)号: CN110070913B 公开(公告)日: 2023-06-27
发明(设计)人: 樊隆;孙岩;吴东明;黄小罗;张丽华;柳振宇 申请(专利权)人: 南京金斯瑞生物科技有限公司
主分类号: G16B25/10 分类号: G16B25/10;G06N3/006;G06N3/126
代理公司: 北京华睿卓成知识产权代理事务所(普通合伙) 11436 代理人: 程淼
地址: 211100 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 一种基于免疫算法的密码子优化方法,其特征在于先后使用免疫算法和遗传算法分别对蛋白质编码序列进行局部多目标优化和全局多目标优化,再用穷举法对序列进行微调优化,从而最大限度的搜索到最优表达序列。本发明既保留了遗传算法随机全局并行搜索的特点,又在相当大程度上避免未成熟收敛,确保快速收敛于全局最优解。本发明第一次结合利用免疫算法与遗传算法的准确度和效率的优势,通过分步流程(依次分别是局部优化、全局优化、微调优化)进行密码子优化,并通过实例测试证明该算法进行密码子优化的高效性。
搜索关键词: 一种 基于 免疫 算法 密码子 优化 方法
【主权项】:
1.一种基于免疫算法的密码子优化方法,其特征在于先后使用免疫算法和遗传算法分别对蛋白质编码序列进行局部多目标优化和全局多目标优化,再用穷举法对序列进行微调优化,从而最大限度的搜索到最优表达序列。
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