[发明专利]基于DNA甲基化数据考虑纯度效应的差异甲基化分析算法在审

专利信息
申请号: 201710615767.9 申请日: 2017-07-26
公开(公告)号: CN107451420A 公开(公告)日: 2017-12-08
发明(设计)人: 张乃千;殷俊锋 申请(专利权)人: 同济大学
主分类号: G06F19/12 分类号: G06F19/12;G06F19/00
代理公司: 上海科律专利代理事务所(特殊普通合伙)31290 代理人: 叶凤
地址: 200092 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 基于DNA甲基化数据考虑纯度效应的差异甲基化分析算法,其特征在于,按步骤包括如下(1)数据的搜集与预处理。(2)肿瘤样本纯度估计。使用InfiniumPurify估计肿瘤样本纯度。(3)差异甲基化分析。所述的差异甲基化分析是把肿瘤样本纯度作为影响差异分析的因素,建立线性模型,利用线性模型中参数估计的统计量开展差异甲基化分析。本发明以机器学习和生物信息学方法为工具,通过肿瘤样本和正常样本的Illumina Infinium 450K DNA甲基化数据进行纯度矫正的差异甲基化分析。
搜索关键词: 基于 dna 甲基化 数据 考虑 纯度 效应 差异 分析 算法
【主权项】:
基于DNA甲基化数据考虑纯度效应的差异甲基化分析算法,其特征在于,按步骤包括如下:(1)数据的搜集与预处理。(2)肿瘤样本纯度估计。使用InfiniumPurify估计肿瘤样本纯度。(3)差异甲基化分析。所述的差异甲基化分析是把肿瘤样本纯度作为影响差异分析的因素,建立线性模型,利用线性模型中参数估计的统计量开展差异甲基化分析。
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