[发明专利]一种将多个重叠组装结果合并的方法有效
| 申请号： | 201710720525.6 | 申请日： | 2017-08-21 |
| 公开（公告）号： | CN107590363B | 公开（公告）日： | 2019-11-08 |
| 发明（设计）人： | 邬三毛;肖世俊;郭文浒;陈楠生 | 申请（专利权）人： | 武汉菲沙基因信息有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/20 | 分类号： | G16B30/20 |
| 代理公司： | 北京轻创知识产权代理有限公司 11212 | 代理人： | 杨立;李蕾 |
| 地址： | 430075 湖北省武汉市*** | 国省代码： | 湖北;42 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种将多个重叠组装结果合并的方法，其特征在于，包括以下步骤：获得多个重叠组装结果；根据所述多个重叠组装结果的数据特征确定前景和背景；将所述前景与所述背景进行比对，得到比对结果；根据所述比对结果，将所述前景与所述背景合并，即得到合并后的重叠组装结果。通过本发明的方法，可大大提高组装过程中的连接效率，并在一定程度上提高连接准确率，并且本发明的可以广泛适用于微生物、动物、植物的基因组辅助组装，其运行速度也比同类方法和软件更快。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 将多个 重叠 组装 结果 合并 方法 | ||
【主权项】：
1.一种将多个重叠组装结果合并的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1：获得多个重叠组装结果，所述重叠组装结果为至少三个；S2：根据所述多个重叠组装结果的数据特征确定前景和背景，将所述重叠组装结果中的一个确定为所述前景，将其余重叠组装结果确定为背景，并根据所述多个背景的数据特征确定每个所述背景与所述前景的合并顺序，按所述合并顺序，将所述前景依次与相应的背景进行比对、合并，每次合并后的重叠组装结果作为下一次比对、合并的前景，通过以下方法确定所述前景、背景和合并顺序：将所述多个重叠组装结果中碱基水平一致性最高的重叠组装结果作为前景，其他重叠组装结果作为背景，按照N50长度从小到大的顺序与所述前景合并，当多个背景N50相等时，按所述背景中的序列数量从小到大的顺序将所述多个背景依次与所述前景合并；S3：将所述前景与所述背景进行比对，得到比对结果；S4：根据所述比对结果，将所述前景与所述背景合并，即得到合并后的重叠组装结果。
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