[发明专利]一种基于转录组测序开发山黧豆EST-SSR引物组及方法和应用有效
| 申请号： | 201710721379.9 | 申请日： | 2017-08-22 |
| 公开（公告）号： | CN107345256B | 公开（公告）日： | 2020-06-26 |
| 发明（设计）人： | 郝晓鹏;王燕;杨涛;刘荣;畅建武;宗续晓;赵建栋;关现民 | 申请（专利权）人： | 山西省农业科学院农作物品种资源研究所;中国农业科学院作物科学研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 太原晋科知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 14110 | 代理人： | 王瑞玲 |
| 地址： | 030013 *** | 国省代码： | 山西;14 |
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| 摘要： | 本发明提供基于转录组测序开发山黧豆EST‑SSR引物组及方法和应用。获得两个不同花色山黧豆品种在苗期的根、茎、叶全部转录本集合，形成原始序列数据库；去除带接头和低质量的测序数据，形成高质量的过滤序列数据库；对高质量的过滤序列进行拼接，还原转录本，将转录本与参考蛋白质数据库NR进行BLAST比对，保留最优比对结果并确定最长序列作为Unigene代表序列。用MISA 1.0进行Unigene中SSR位点的扫描；primer 3.0进行SSR引物设计，筛选SSR引物，对43份山黧豆材料进行指纹图谱构建。本发明方便、快速、准确、成本低廉，为山黧豆SSR引物开发和种质资源鉴定提供了新思路。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 转录 组测序 开发 山黧豆 est ssr 引物 方法 应用 | ||
【主权项】：
一种基于转录组测序开发山黧豆EST‑SSR引物组，其特征在于：所述引物组包括８对引物，其核苷酸序列如序列表 SEQ ID NO.1‑16所示。
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