[发明专利]十倍体长穗偃麦草专化分子标记与探针的开发及其应用

摘要

本发明公开了十倍体长穗偃麦草专化分子标记与探针的开发及其应用。本发明利用特异性长度扩增片段测序技术(SLAF‑seq)对普通小麦、普通小麦‑十倍体长穗偃麦草易位系和十倍体长穗偃麦草进行测序，通过序列数据比对分析获得十倍体长穗偃麦草特异序列，并以十倍体长穗偃麦草特异序列为基础，开发了长穂偃麦草的专化分子标记和专化荧光探针。本发明开发的分子标记不仅可以用于快速检测十倍体长穂偃麦草染色质及长穗偃麦草向小麦转移染色体片段过程中的易位系鉴定，而且为分子标记辅助选择改良小麦遗传特性提供重要途径，也为小麦分子育种、系统进化和种质资源鉴定提供重要的应用基础。

主权项

一种长穗偃麦草染色体分子标记，为如下A1)或A2)：A1)是以长穗偃麦草的基因组DNA为模板，采用引物对64进行扩增得到的DNA分子：A2)是以长穗偃麦草的基因组DNA为模板，采用如下引物对1‑引物对67中的任一对进行扩增得到的DNA分子：所述引物对1由序列1所示的单链DNA分子和序列2所示的单链DNA分子组成；所述引物对2由序列3所示的单链DNA分子和序列4所示的单链DNA分子组成；所述引物对3由序列5所示的单链DNA分子和序列6所示的单链DNA分子组成；所述引物对4由序列7所示的单链DNA分子和序列8所示的单链DNA分子组成；所述引物对5由序列9所示的单链DNA分子和序列10所示的单链DNA分子组成；所述引物对6由序列11所示的单链DNA分子和序列12所示的单链DNA分子组成；所述引物对7由序列13所示的单链DNA分子和序列14所示的单链DNA分子组成；所述引物对8由序列15所示的单链DNA分子和序列16所示的单链DNA分子组成；所述引物对9由序列17所示的单链DNA分子和序列18所示的单链DNA分子组成；所述引物对10由序列19所示的单链DNA分子和序列20所示的单链DNA分子组成；所述引物对11由序列21所示的单链DNA分子和序列22所示的单链DNA分子组成；所述引物对12由序列23所示的单链DNA分子和序列24所示的单链DNA分子组成；所述引物对13由序列25所示的单链DNA分子和序列26所示的单链DNA分子组成；所述引物对14由序列27所示的单链DNA分子和序列28所示的单链DNA分子组成；所述引物对15由序列29所示的单链DNA分子和序列30所示的单链DNA分子组成；所述引物对16由序列31所示的单链DNA分子和序列32所示的单链DNA分子组成；所述引物对17由序列33所示的单链DNA分子和序列34所示的单链DNA分子组成；所述引物对18由序列35所示的单链DNA分子和序列36所示的单链DNA分子组成；所述引物对19由序列37所示的单链DNA分子和序列38所示的单链DNA分子组成；所述引物对20由序列39所示的单链DNA分子和序列40所示的单链DNA分子组成；所述引物对21由序列41所示的单链DNA分子和序列42所示的单链DNA分子组成；所述引物对22由序列43所示的单链DNA分子和序列44所示的单链DNA分子组成；所述引物对23由序列45所示的单链DNA分子和序列46所示的单链DNA分子组成；所述引物对24由序列47所示的单链DNA分子和序列48所示的单链DNA分子组成；所述引物对25由序列49所示的单链DNA分子和序列50所示的单链DNA分子组成；所述引物对26由序列51所示的单链DNA分子和序列52所示的单链DNA分子组成；所述引物对27由序列53所示的单链DNA分子和序列54所示的单链DNA分子组成；所述引物对28由序列55所示的单链DNA分子和序列56所示的单链DNA分子组成；所述引物对29由序列57所示的单链DNA分子和序列58所示的单链DNA分子组成；所述引物对30由序列59所示的单链DNA分子和序列60所示的单链DNA分子组成；所述引物对31由序列61所示的单链DNA分子和序列62所示的单链DNA分子组成；所述引物对32由序列63所示的单链DNA分子和序列64所示的单链DNA分子组成；所述引物对33由序列65所示的单链DNA分子和序列66所示的单链DNA分子组成；所述引物对34由序列67所示的单链DNA分子和序列68所示的单链DNA分子组成；所述引物对35由序列69所示的单链DNA分子和序列70所示的单链DNA分子组成；所述引物对36由序列71所示的单链DNA分子和序列72所示的单链DNA分子组成；所述引物对37由序列73所示的单链DNA分子和序列74所示的单链DNA分子组成；所述引物对38由序列75所示的单链DNA分子和序列76所示的单链DNA分子组成；所述引物对39由序列77所示的单链DNA分子和序列78所示的单链DNA分子组成；所述引物对40由序列79所示的单链DNA分子和序列80所示的单链DNA分子组成；所述引物对41由序列81所示的单链DNA分子和序列82所示的单链DNA分子组成；所述引物对42由序列83所示的单链DNA分子和序列84所示的单链DNA分子组成；所述引物对43由序列85所示的单链DNA分子和序列86所示的单链DNA分子组成；所述引物对44由序列87所示的单链DNA分子和序列88所示的单链DNA分子组成；所述引物对45由序列89所示的单链DNA分子和序列90所示的单链DNA分子组成；所述引物对46由序列91所示的单链DNA分子和序列92所示的单链DNA分子组成；所述引物对47由序列93所示的单链DNA分子和序列94所示的单链DNA分子组成；所述引物对48由序列95所示的单链DNA分子和序列96所示的单链DNA分子组成；所述引物对49由序列97所示的单链DNA分子和序列98所示的单链DNA分子组成；所述引物对50由序列99所示的单链DNA分子和序列100所示的单链DNA分子组成；所述引物对51由序列101所示的单链DNA分子和序列102所示的单链DNA分子组成；所述引物对52由序列103所示的单链DNA分子和序列104所示的单链DNA分子组成；所述引物对53由序列105所示的单链DNA分子和序列106所示的单链DNA分子组成；所述引物对54由序列107所示的单链DNA分子和序列108所示的单链DNA分子组成；所述引物对55由序列109所示的单链DNA分子和序列110所示的单链DNA分子组成；所述引物对56由序列111所示的单链DNA分子和序列112所示的单链DNA分子组成；所述引物对57由序列113所示的单链DNA分子和序列114所示的单链DNA分子组成；所述引物对58由序列115所示的单链DNA分子和序列116所示的单链DNA分子组成；所述引物对59由序列117所示的单链DNA分子和序列118所示的单链DNA分子组成；所述引物对60由序列119所示的单链DNA分子和序列120所示的单链DNA分子组成；所述引物对61由序列121所示的单链DNA分子和序列122所示的单链DNA分子组成；所述引物对62由序列123所示的单链DNA分子和序列124所示的单链DNA分子组成；所述引物对63由序列125所示的单链DNA分子和序列126所示的单链DNA分子组成；所述引物对64由序列127所示的单链DNA分子和序列128所示的单链DNA分子组成；所述引物对65由序列129所示的单链DNA分子和序列130所示的单链DNA分子组成；所述引物对66由序列131所示的单链DNA分子和序列132所示的单链DNA分子组成；所述引物对67由序列133所示的单链DNA分子和序列134所示的单链DNA分子组成。