[发明专利]一种确定最佳SNP数量及其通过筛选标记对大黄鱼生产性能进行基因组选择育种的方法有效
申请号: | 201710755157.9 | 申请日: | 2017-08-29 |
公开(公告)号: | CN107338321B | 公开(公告)日: | 2020-05-19 |
发明(设计)人: | 王志勇;董林松;肖世俊 | 申请(专利权)人: | 集美大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;G16B5/20;G16B20/20 |
代理公司: | 厦门市精诚新创知识产权代理有限公司 35218 | 代理人: | 姜成康 |
地址: | 361000 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | 本发明公开了一种确定最佳SNP数量及通过筛选标记对大黄鱼生产性能进行基因组选择育种的方法。先对参考群个体进行生产性能的表型测定和基因组测序,获得SNP位点;筛选出合格的SNP位点,并将缺失的基因型补齐;将参考群分为训练集和验证集进行杂交验证;通过单标记分析筛选与性状最显著关联的SNP位点,然后只使用这些位点通过GBLUP方法计算验证集个体的GEBV;进一步得到各个筛选SNP数量下的育种值估计准确度;最后确定SNP筛选的最佳数量。再根据该最佳数量,通过GBLUP方法计算出GEBV,进一步得到育种值估计准确度,根据该值的高低进行基因组选择育种。本发明可显著节省对大黄鱼生产性能的基因组选择费用。 | ||
搜索关键词: | 一种 确定 最佳 snp 数量 及其 通过 筛选 标记 大黄鱼 生产 性能 进行 基因组 选择 | ||
【主权项】:
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