[发明专利]一种获得艾纳香的转录组及功能基因的方法在审
| 申请号： | 201710776306.X | 申请日： | 2017-08-31 |
| 公开（公告）号： | CN109423490A | 公开（公告）日： | 2019-03-05 |
| 发明（设计）人： | 官玲亮;庞玉新;张影波;王凯;陈振夏;黄梅;谢小丽;胡璇 | 申请（专利权）人： | 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所 |
| 主分类号： | C12N15/10 | 分类号： | C12N15/10;C12N15/29 |
| 代理公司： | 深圳市千纳专利代理有限公司 44218 | 代理人： | 李平 |
| 地址： | 57173*** | 国省代码： | 海南;46 |
| 权利要求书： | 暂无信息 | 说明书： | 暂无信息 |
| 摘要： | 本发明提供了一种获得艾纳香的转录组及功能基因的方法：(a)提取艾纳香的总RNA，分离出3’端带有polyA的mRNA，随机打断mRNA，反转录并合成双链cDAN；(b)对获得的序列进行测序；(c)将测序结果进行拼接与组装，获得Unigene，并确定其方向；(d)对获得的基因转录本分别进行生物信息学分析，即得。采用该方法共得到48197273个序列信息，100341条Unigene；包含RNA‑seq名称、序列长度及表达数、COG预测、COG功能注释、KEGG注释、KEGG‑pathway、GO注释的共60477条信息；包括对获得的序列信息进行CDS核酸序列预测的蛋白功能注释共37283条信息。 | ||
| 搜索关键词： | 艾纳香 功能基因 序列信息 转录组 测序 生物信息学分析 基因转录本 蛋白功能 功能注释 核酸序列 成双链 反转录 总RNA 预测 并合 拼接 打断 组装 | ||
【主权项】：
1.一种获得艾纳香的转录组及功能基因的方法，其特征在于，包括以下步骤：(a)提取艾纳香的总RNA，分离出3’端带有polyA的mRNA，随机打断mRNA回收200‑700bp片段，反转录并合成双链cDAN；(b)对获得的序列进行测序；(c)将测序结果进行拼接与组装，获得Unigene，并确定其方向；(d)对获得的基因转录本分别进行生物信息学分析，从而获得艾纳香的基因信息及功能基因。
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