[发明专利]一种高密度遗传图谱的构建方法有效
| 申请号： | 201710804279.2 | 申请日： | 2017-09-08 |
| 公开（公告）号： | CN107644150B | 公开（公告）日： | 2021-03-19 |
| 发明（设计）人： | 蔡庆乐;唐耀华;何荣军 | 申请（专利权）人： | 杭州和壹基因科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B40/00 | 分类号： | G16B40/00;G16B20/20 |
| 代理公司： | 杭州中成专利事务所有限公司 33212 | 代理人： | 唐银益 |
| 地址： | 310051 浙江省杭州市滨*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种高密度遗传图谱的构建方法，步骤是1)根据遗传分离群体高通量测序数据中得到的SNP标记，对标记进行基因型分型和过滤，再计算两两之间的重组率；2)利用步骤1)算得的重组率，采用分层聚类算法根据前述遗传分离群体的染色体数对SNP标记进行分组，得到与染色体数对应的连锁群；3)采用最小生成树算法对标记进行排序，对排序后的SNP标记进行补缺失和纠错处理，最后计算遗传距离得到遗传图谱。本发明针对不同的遗传分离群体高效、高准确率的构建遗传图谱，为后续的生物信息学分析和遗传学研究提供有力支持。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 高密度 遗传 图谱 构建 方法 | ||
【主权项】：
一种高密度遗传图谱的构建方法，其特征在于，它包括以下步骤：1)根据遗传分离群体高通量测序数据中得到的SNP标记，对SNP标记进行基因型分型和过滤，再计算两两之间的重组率；2)利用步骤1)算得的重组率，采用分层聚类算法根据前述遗传分离群体的染色体数对SNP标记进行分组，得到与染色体数对应的连锁群；3)采用最小生成树算法对SNP标记进行排序，对排序后的SNP标记进行补缺失和纠错处理，最后计算遗传距离得到遗传图谱。
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