[发明专利]一种泛癌症基因表达和甲基化关联分析方法在审
| 申请号： | 201710838076.5 | 申请日： | 2017-09-18 |
| 公开（公告）号： | CN107766697A | 公开（公告）日： | 2018-03-06 |
| 发明（设计）人： | 杨利英;耿芳歌 | 申请（专利权）人： | 西安电子科技大学 |
| 主分类号： | G06F19/22 | 分类号： | G06F19/22;G06F19/20;G06F19/24 |
| 代理公司： | 西安长和专利代理有限公司61227 | 代理人： | 黄伟洪 |
| 地址： | 710071 陕西省*** | 国省代码： | 陕西;61 |
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| 摘要： | 本发明属于生物信息学和监督学习方法技术领域，公开了一种泛癌症基因表达和甲基化关联分析方法，利用结合线性模型和经验贝叶斯的稳健t检验方法筛选出差异表达基因和差异甲基化位点；将差异基因和甲基化位点与蛋白质交互作用网络结合，发现显著差异性模块以PPI蛋白质交互作用网络为架构；错误发现率FDR大于阈值的子网模块删除，得到具有统计显著性的子网模块；找出基因表达和甲基化之间相似的关联模式和共同的调节基因。本发明结合PPI网络，寻找影响癌症发生的分子通路，使用SPG模块发现算法，得出的子网模块具有生物意义。本发明用于发现不同癌症间的相同的致病模式，从而更好地应用于癌症致病机理。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 癌症 基因 表达 甲基化 关联 分析 方法 | ||
【主权项】：
一种泛癌症基因表达和甲基化关联分析方法，其特征在于，所述泛癌症基因表达和甲基化关联分析方法利用结合线性模型和经验贝叶斯的稳健t检验方法筛选出差异表达基因和差异甲基化位点；将差异基因和甲基化位点与蛋白质交互作用网络结合，发现显著差异性模块以PPI蛋白质交互作用网络为架构；错误发现率FDR大于阈值的子网模块删除，得到具有统计显著性的子网模块；找出基因表达和甲基化之间相似的关联模式和共同的调节基因。
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