[发明专利]基于三维子结构的药物分子比较方法有效
| 申请号： | 201710852115.7 | 申请日： | 2017-09-20 |
| 公开（公告）号： | CN107657146B | 公开（公告）日： | 2020-05-05 |
| 发明（设计）人： | 徐峻;利秀明;严鑫 | 申请（专利权）人： | 广州市爱菩新医药科技有限公司 |
| 主分类号： | G16C20/50 | 分类号： | G16C20/50;G16C20/70 |
| 代理公司： | 广州市合本知识产权代理事务所(普通合伙) 44421 | 代理人： | 谭启斌 |
| 地址： | 511458 广东省广州市南沙*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于三维子结构的药物分子比较方法，涉及药物分子的设计与筛选技术领域。所述方法包括如下步骤：读入库分子的二维或三维结构信息，得到库分子的子结构匹配原子序列；读入查询分子和库分子的三维结构信息，以及查询子结构的相关信息，分别计算查询分子、库分子各自子结构的自身重叠体积与各自边链的自身重叠体积；计算查询分子和库分子多种叠合情况下的重叠体积；分别计算查询分子和库分子子结构相似度。所述方法能提高分子形状比较的灵活性，更利于先导化合物的发现，可应用于药物分子的虚拟筛选。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 三维 结构 药物 分子 比较 方法 | ||
【主权项】：
一种基于三维子结构的药物分子比较方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：读入库分子的二维或三维结构信息，定义查询子结构，得到库分子的子结构匹配原子序列；读入查询分子和库分子的三维结构信息，以及查询子结构的相关信息，分别计算查询分子、库分子各自子结构的自身重叠体积与各自边链的自身重叠体积；计算查询分子和库分子多种叠合情况下的重叠体积；根据查询分子子结构的自身重叠体积和边链的自身重叠体积，库分子子结构的自身重叠体积和边链的自身重叠体积和两分子的子结构及边链的叠合体积，分别计算查询分子和库分子子结构相似度,以及边链相似度，以子结构相似度和边链相似度作为两分子的综合相似度，当库分子匹配子结构有多个时，比较各个匹配子结构下两分子综合相似度，选择其中最大值作为两分子的综合相似度。
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