[发明专利]一种基于高通量测序检测青虾肠道乳酸菌的方法在审
| 申请号： | 201710946112.X | 申请日： | 2017-10-12 |
| 公开（公告）号： | CN107557438A | 公开（公告）日： | 2018-01-09 |
| 发明（设计）人： | 段翠兰;张徐祥;赵艳婷;叶林;陈焕根;王苗苗 | 申请（专利权）人： | 江苏省渔业技术推广中心;南京大学 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12Q1/04 |
| 代理公司： | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙)32204 | 代理人： | 王艳丽,李倩 |
| 地址： | 210036 江苏省南*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于高通量测序检测青虾肠道乳酸菌的方法，包括DNA提取提取待检测青虾肠道的DNA；PCR扩增针对细菌16S rRNA基因高可变区V3‑V4区域设计引物，以所述的DNA为模板进行PCR扩增；高通量测序将PCR扩增的产物纯化后构建基因文库，进行高通量测序；数据处理测序的数据经前处理后，进行统计分析，获得微生物的群落结构、物种组成比例及丰度，进一步查阅文献，确定属水平上不同的乳酸菌，并在微生物群落结构数据中查找相应的乳酸菌，确定乳酸菌丰度。本发明相较于传统的培养分离法、分子水平检测方法而言，具有高灵敏度、快速定量、成本低廉等优势，在评估不同样品中乳酸菌丰度具有实际应用价值。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 通量 检测 青虾 肠道 乳酸菌 方法 | ||
【主权项】：
一种基于高通量测序检测青虾肠道乳酸菌的方法，其特征在于，包括：(1)DNA提取：提取待检测青虾肠道的DNA；(2)PCR扩增：针对细菌16S rRNA基因高可变区V3‑V4区域设计引物，以所述的DNA为模板进行PCR扩增；(3)高通量测序：将PCR扩增的产物纯化后构建基因文库，进行高通量测序；(4)数据处理：测序的数据经前处理后，进行统计分析，获得微生物的群落结构、物种组成比例及丰度，进一步查阅文献，确定属水平上不同的乳酸菌，并在微生物群落结构数据中查找相应的乳酸菌，确定乳酸菌丰度。
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