[发明专利]用于检测簇毛麦染色体臂的成套分子标记及其应用

摘要

本发明公开了一种用于检测簇毛麦染色体臂的成套分子标记及其应用。本发明提供了用于检测簇毛麦染色体臂的成套引物，由用于检测簇毛麦2V、3V、4V、6V和7V染色体臂的引物对(序列表中序列1‑28所示的14个引物对)中的全部或部分组成。本发明利用RNA‑seq技术获得了簇毛麦的转录组序列，在转录组序列的基础上，设计引物，筛选能准确鉴定簇毛麦各条染色体的特异标记并设计相应的扩增引物。实验证明，采用本发明所提供的成套引物可以实现对簇毛麦各条染色体的特异性检测，已成功应用于硬‑簇双二倍体与小麦杂交及回交后代材料中簇毛麦染色体的检测工作。本发明为簇毛麦的进一步研究和利用提供了更便捷有效的工具。

主权项

用于检测簇毛麦染色体臂的成套引物，由用于检测簇毛麦2V染色体臂的引物对、用于检测簇毛麦3V染色体臂的引物对、用于检测簇毛麦4V染色体臂的引物对、用于检测簇毛麦6V染色体臂的引物对和用于检测簇毛麦7V染色体臂的引物对中的全部或部分组成；所述用于检测簇毛麦2V染色体臂的引物对为引物对1；所述用于检测簇毛麦3V染色体臂的引物对为引物对2或引物对3或引物对4或引物对5；所述用于检测簇毛麦4V染色体臂的引物对为引物对6或引物对7或引物对8或引物对9；所述用于检测簇毛麦6V染色体臂的引物对为引物对10或引物对11或引物对12；所述用于检测簇毛麦7V染色体臂的引物对为引物对13或引物对14；所述引物对1为如下(a1)或(b1)：(a1)由序列表中序列1和序列2所示的两条引物组成的引物对；(b1)由将序列表中序列1和序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条引物组成且具有相同功能的引物对；所述引物对2为如下(a2)或(b2)：(a2)由序列表中序列3和序列4所示的两条引物组成的引物对；(b2)由将序列表中序列3和序列4经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条引物组成且具有相同功能的引物对；所述引物对3为如下(a3)或(b3)：(a3)由序列表中序列5和序列6所示的两条引物组成的引物对；(b3)由将序列表中序列5和序列6经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条引物组成且具有相同功能的引物对；所述引物对4为如下(a4)或(b4)：(a4)由序列表中序列7和序列8所示的两条引物组成的引物对；(b4)由将序列表中序列7和序列8经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条引物组成且具有相同功能的引物对；所述引物对5为如下(a5)或(b5)：(a5)由序列表中序列9和序列10所示的两条引物组成的引物对；(b5)由将序列表中序列9和序列10经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条引物组成且具有相同功能的引物对；所述引物对6为如下(a6)或(b6)：(a6)由序列表中序列11和序列12所示的两条引物组成的引物对；(b6)由将序列表中序列11和序列12经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条引物组成且具有相同功能的引物对；所述引物对7为如下(a7)或(b7)：(a7)由序列表中序列13和序列14所示的两条引物组成的引物对；(b7)由将序列表中序列13和序列14经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条引物组成且具有相同功能的引物对；所述引物对8为如下(a8)或(b8)：(a8)由序列表中序列15和序列16所示的两条引物组成的引物对；(b8)由将序列表中序列15和序列16经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条引物组成且具有相同功能的引物对；所述引物对9为如下(a9)或(b9)：(a9)由序列表中序列17和序列18所示的两条引物组成的引物对；(b9)由将序列表中序列17和序列18经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条引物组成且具有相同功能的引物对；所述引物对10为如下(a10)或(b10)：(a10)由序列表中序列19和序列20所示的两条引物组成的引物对；(b10)由将序列表中序列19和序列20经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条引物组成且具有相同功能的引物对；所述引物对11为如下(a11)或(b11)：(a11)由序列表中序列21和序列22所示的两条引物组成的引物对；(b11)由将序列表中序列21和序列22经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条引物组成且具有相同功能的引物对；所述引物对12为如下(a12)或(b12)：(a12)由序列表中序列23和序列24所示的两条引物组成的引物对；(b12)由将序列表中序列23和序列24经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条引物组成且具有相同功能的引物对；所述引物对13为如下(a13)或(b13)：(a13)由序列表中序列25和序列26所示的两条引物组成的引物对；(b13)由将序列表中序列25和序列26经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条引物组成且具有相同功能的引物对；所述引物对14为如下(a14)或(b14)：(a14)由序列表中序列27和序列28所示的两条引物组成的引物对；(b14)由将序列表中序列27和序列28经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条引物组成且具有相同功能的引物对。