[发明专利]一种利用PacBio单分子测序批量高精度获得昆虫COI基因条形码区域的方法在审
| 申请号： | 201710982804.X | 申请日： | 2017-10-20 |
| 公开（公告）号： | CN107641646A | 公开（公告）日： | 2018-01-30 |
| 发明（设计）人： | 刘山林;杨琛涛;周程冉;周欣 | 申请（专利权）人： | 深圳华大生命科学研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司11245 | 代理人： | 关畅,何叶喧 |
| 地址： | 518083 广东省深圳市盐*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种利用PacBio单分子测序批量高精度获得昆虫COI基因条形码区域的方法。本发明提供的方法包括如下步骤(1)将多个昆虫的DNA样本分别进行PCR扩增；正向引物依次包括正向标签和对应于昆虫COI基因的正向片段，反向引物依次包括反向标签和对应于昆虫COI基因的反向片段；正向引物中的正向片段均相同，反向引物中的反向片段均相同；每两个正向引物的正向标签之间至少具有2个核苷酸的差异；每两个反向引物的反向标签之间至少具有2个核苷酸的差异；(2)分别取所有PCR扩增的扩增产物，混合，得到混合样本；(3)将混合样本进行第三代测序。本发明对于高通量获得昆虫COI基因条形码序列具有重大的应用推广价值。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 利用 pacbio 分子 批量 高精度 获得 昆虫 coi 基因 条形码 区域 方法 | ||
【主权项】：
一种获得昆虫的COI基因条形码序列的方法，包括如下步骤：(1)将多个昆虫的DNA样本分别进行PCR扩增；每个PCR扩增的引物对均由正向引物和反向引物组成，正向引物自5’末端至3’末端依次包括正向标签和对应于昆虫COI基因的正向片段，反向引物自5’末端至3’末端依次包括反向标签和对应于昆虫COI基因的反向片段；所有PCR扩增的正向引物中的正向片段均相同，所有PCR扩增的反向引物中的反向片段均相同；所有PCR扩增的正向引物中，每两个正向引物的正向标签之间至少具有2个核苷酸的差异；所有PCR扩增的反向引物中，每两个反向引物的反向标签之间至少具有2个核苷酸的差异；(2)分别取步骤(1)得到的所有PCR扩增的扩增产物，混合，得到混合样本；(3)将混合样本进行第三代测序，得到多个昆虫的COI基因条形码序列。
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