[发明专利]一种检测晋南牛IGF1R基因CNV标记的方法及其应用

摘要

本发明公开了一种检测晋南牛IGF1R基因CNV标记的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以晋南牛的耳组织全基因组DNA为模板，利用一对特异引物IGF1R‑CNV扩增牛IGF1R基因的拷贝数变异区域，同时利用另外一对特异引物BTF3‑CNV扩增牛BTF3基因片段作为对照，然后利用2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数，本发明提供的方法为建立晋南牛IGF1R基因拷贝数与生长性状之间的关联奠定了基础，通过对拷贝数变异与生长性状进行的关联分析，有利于加快晋南牛分子标记辅助选择育种工作。该方法简单、快速、便于推广应用。

主权项

一种检测晋南牛IGF1R基因CNV标记的方法，其特征在于：包括以下步骤：利用实时荧光定量PCR，以晋南牛的基因组DNA为模板，以引物对IGF1R‑CNV为引物，扩增IGF1R基因的拷贝数变异区域，同时以引物对BTF3‑CNV为引物扩增作为内参的BTF3基因的部分片段，然后根据定量结果鉴定晋南牛IGF1R基因上CNV标记的拷贝数变异类型；所述的引物对IGF1R‑CNV为：上游引物F1：5’‑GACTATGGCACCAGTGTTTGT‑3’下游引物R1：5’‑CCTTGAGGCTATCGCTGTATT‑3’；所述的引物对BTF3‑CNV为：上游引物F2：5’‑CAAGAAGACTCATTCCTT‑3’下游引物R2：5’‑CACAAGCACATTATTCAC‑3’。