[发明专利]一种肺癌EGFRL858R和19Del的ddPCR检测方法及应用在审
申请号: | 201711003578.2 | 申请日: | 2017-10-24 |
公开(公告)号: | CN107663533A | 公开(公告)日: | 2018-02-06 |
发明(设计)人: | 刘园园;王一杏;张晓妮 | 申请(专利权)人: | 深圳海普洛斯医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/6886 |
代理公司: | 北京联瑞联丰知识产权代理事务所(普通合伙)11411 | 代理人: | 陈剑聪 |
地址: | 518000 广东省深圳市南山区*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明涉及医学和生物技术领域,具体涉及一种肺癌EGFR L858R和19Del的ddPCR检测方法及应用,检测方法包括对外周血的血细胞和血浆分离、采用两步纯化法进行cfDNA的提取、针对肺癌相关的EGFR L858R位点和EGFR 19号外显子缺失位点分别设计2个探针和1对引物、以提取的cfDNA为模板进行ddPCR检测、最后对获得的扩增产物进行数据分析,获得EGFR敏感性突变L858R和19Del的比例;应用包括在肿瘤患者治疗中的应用,在肺癌晚期治疗过程中,针对肺癌患者提供用药相关基因位点突变信息,为肺癌个体化精准用药指导、药效评估以及疗效监测提供了重要的参考依据。 | ||
搜索关键词: | 一种 肺癌 egfrl858r 19 del ddpcr 检测 方法 应用 | ||
【主权项】:
一种肺癌EGFR L858R和19Del的ddPCR检测方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)提供肺癌患者外周血样本,对所提供的外周血样本进行血细胞和血浆分离;(2)对分离获得的血浆样本采用两步纯化法进行cfDNA的提取,获得cfDNA提取物;(3)针对肺癌相关的EGFR L858R位点设计2个探针如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示、和1对引物如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示;针对肺癌相关的EGFR 19号外显子缺失位点设计2个探针如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示、和1对引物如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示;(4)以提取的cfDNA为模板,进行ddPCR检测,获得含有敏感性突变位点的扩增产物;(5)对获得的扩增产物进行数据分析,获得EGFR敏感性突变L858R和19Del的比例。
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