[发明专利]基于DNA标记的犬类品系鉴定方法有效
申请号: | 201711109335.7 | 申请日: | 2017-11-11 |
公开(公告)号: | CN107871060B | 公开(公告)日: | 2020-10-09 |
发明(设计)人: | 刘毓文;杨承;耿灿 | 申请(专利权)人: | 深圳深知生物科技有限公司 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00;G16B40/00;G16B50/30;G06K9/62 |
代理公司: | 深圳卓正专利代理事务所(普通合伙) 44388 | 代理人: | 万正平 |
地址: | 518100 广东省深圳*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了一种通过宠物犬DNA SNP标记准确进行品系鉴定的方法,所述方法包括步骤:1)获得宠物犬DNA SNP标记数据;2)对步骤1)中所述的SNP标记数据进行层次聚类,所述层次聚类中加入了迁徙的参数;3)对步骤1)中所述的SNP标记数据进行种群混合物分析,所述种群混合物分析中,对混合品系的数量加以限制;4)将基因组分成小块区域,并对每一个区域用随机森林算法进行犬种归类,用隐马尔可夫链对小块基因区域的品系归类进行平滑处理,用最大似然估计对家族谱系进行估计,获得犬只父母的品系混合成分,完成谱系推断。 | ||
搜索关键词: | 基于 dna 标记 品系 鉴定 方法 | ||
【主权项】:
一种通过宠物犬DNA SNP标记准确进行品系鉴定的方法,所述方法包括步骤:1)获得未知品系宠物犬DNA SNP标记数据,2)对步骤1)中所述的SNP标记数据进行层次聚类,所述层次聚类中加入了迁徙的参数;3)对步骤1)中所述的SNP标记数据进行种群混合物分析,所述种群混合物分析中,对混合品系的数量加以限制;4)将基因组分成小块区域,并对每一个区域用随机森林算法进行犬种归类,用隐马尔可夫链对小块基因区域的品系归类进行平滑处理,用最大释然估计对家族谱系进行估计,获得犬只父母的品系混合成分,完成谱系推断。
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