[发明专利]一种用于鉴定霍山石斛或铁皮石斛的系统发育树及鉴定方法在审
申请号: | 201711111231.X | 申请日: | 2017-11-13 |
公开(公告)号: | CN107630104A | 公开(公告)日: | 2018-01-26 |
发明(设计)人: | 赵群;孙传伯 | 申请(专利权)人: | 皖西学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 合肥市科融知识产权代理事务所(普通合伙)34126 | 代理人: | 吴悠 |
地址: | 237000 *** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | 本发明公开了一种用于鉴定霍山石斛或铁皮石斛的系统发育树及鉴定方法,属于霍山石斛或铁皮石斛鉴定技术领域。所述系统发育树包括用霍山石斛、铁皮石斛及部分相近物种的一段特定DNA序列作为内群,用菱唇石斛的2条特定DNA序列作为外群。所述霍山石斛的特定DNA序列通过测序获得,霍山石斛的部分相近物种和菱唇石斛的特定DNA序列来自于GenBank。分别用贝叶斯法和简约法进行系统发育分析,构建BI系统树和MP系统树。本发明通过构建霍山石斛、铁皮石斛及部分相似种的系统发育树,通过对霍山石斛与铁皮石斛之间的特定DNA序列进行对位排序和比较,能够快速、准确鉴别霍山石斛与铁皮石斛,为霍山石斛鉴别提供了新方法。 | ||
搜索关键词: | 一种 用于 鉴定 霍山 石斛 铁皮 系统发育 方法 | ||
【主权项】:
一种用于鉴定霍山石斛的系统发育树,其特征在于:所述系统发育树的外群为菱唇石斛的2条特定DNA序列,其中,所述菱唇石斛的2条特定DNA序列的GenBank登录号分别为AF521612和EU840697,所述系统发育树的内群至少包括待鉴定石斛和霍山石斛,所述特定DNA序列是“18S基因和16S基因之间的一段非编码DNA序列,长度在600bp到700bp之间。
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