[发明专利]一种iTRAQ标记在骨关节炎模型中的使用方法在审
申请号: | 201711169092.6 | 申请日: | 2017-11-22 |
公开(公告)号: | CN107655998A | 公开(公告)日: | 2018-02-02 |
发明(设计)人: | 于思创;王海云 | 申请(专利权)人: | 南宁科城汇信息科技有限公司 |
主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02 |
代理公司: | 南宁指北针知识产权代理事务所(特殊普通合伙)45120 | 代理人: | 于勤,林培 |
地址: | 530022 广西壮族自治区南*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | 本发明公开了一种iTRAQ标记在骨关节炎模型中的使用方法,①样本准备②高效液相(LC)去除高丰度蛋白③调节蛋白样品浓度④iTRAQ试剂标记⑤强阳离子交换柱(SCX)分离⑥nano LC点靶分离将SCX分离组分收集后冻干,经反相色谱分离并点靶⑦质谱检测质谱采集900‑4000 m/z的图谱,每个靶点累计采集1500次;本发明通过人群样本进行标志物的确认,评估这些OA候选标志物诊断OA的价值并分析其与临床的相关性,提出它们在OA的预防、早期诊断等临床应用方面的可行性,及其在人群骨关节健康预警中的意义。 | ||
搜索关键词: | 一种 itraq 标记 骨关节炎 模型 中的 使用方法 | ||
【主权项】:
一种iTRAQ标记在骨关节炎模型中的使用方法,其特征在于:由以下步骤组成:①样本准备:STR/ort模型小鼠和对照小鼠各10只养至20周龄(成年),每只鼠经眼球取血0.9‑1.5 mL; 血样4℃静置1 h 后,5000 r/min离心5 min,取上清液,按50 μL/管装入0.2 mL EP管,做好标注,‑80℃保存备用;②高效液相(LC)去除高丰度蛋白:样品预处理,STR/ort模型小鼠和对照小鼠各10份血清分别等体积混匀成STR/ort模型组和对照组pool 样,按pool 样:bufferA=1:3比例(即样品25 μL,bufferA75 μL)混合,共100 μL;0.22μm滤膜过滤后,STR/ort模型和对照两组混合血清样本分别用LC分离去除高丰度蛋白;③调节蛋白样品浓度:收集LC分离后的非高丰度组分,经超滤管超滤浓缩脱盐,取超滤管内容物测定蛋白含量,调整蛋白浓度至同一水平,并经SDS‑PAGE电泳证实后,STR/ort模型和对照组各取100μg 血样进入下一步实验;④iTRAQ试剂标记:血样进行酶解、还原烷基化等处理后,分别加入iTRAQ 113、114标记,冻干后,用含0.1% TFA的纯水复溶后进行LC分离;⑤强阳离子交换柱(SCX)分离:利用SCX柱在LC上梯度分离样本;柱子:Polysulfoethyl 4.6×100mm column (5μ,200埃)(PolyLC Inc,Maryland,U.S.A);SCX Buffers:Buffer A(CEX Loading buffer 10mM KH2PO4 , PH3.0 , 25%ACN);Buffer B(CEX Elution buffer 10Mm KH2PO4, 500mM KCl,25%ACN);每分钟收集1管;⑥nano LC点靶分离:将SCX分离组分收集后冻干,经反相色谱分离并点靶(Tempo LC );柱子:MICHROM,CP3/61261/00,0.2×150mm Magic C18AQ 3μ 200埃;靶盘上MALDI‑TOF/TOF质谱仪检测;⑦质谱检测:质谱采集900‑4000 m/z的图谱, 每个靶点累计采集1500 次;高压设置为2 kV,信噪比 S/N设置为 >45, 差异蛋白的分析采用5800 MALDI‑TOF/TOF Analyzer 软件。
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