[发明专利]一种用于构建16SrRNA基因扩增子测序文库的引物组及构建方法有效
申请号: | 201711227482.4 | 申请日: | 2017-11-29 |
公开(公告)号: | CN107829146B | 公开(公告)日: | 2021-07-09 |
发明(设计)人: | 伍泳彰;陈杰 | 申请(专利权)人: | 广州赛哲生物科技股份有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C12N15/11;C12Q1/6869 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 单香杰 |
地址: | 510320 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
权利要求书: | 暂无信息 | 说明书: | 暂无信息 |
摘要: | 本发明公开了一种用于构建16S rRNA基因扩增子测序文库的四重标签引物组,所述四重标签引物组由第一步PCR两重标签引物对和第二步PCR两重标签引物对组成;所述第一步PCR两重标签引物对的上游引物的序列为SEQ ID NO:1~8中的任一条,下游引物的序列为SEQ ID NO:9~20中的任一条;所述第二步PCR两重标签引物对的上游引物的序列为SEQ ID NO:21~44中的任一条,下游引物的序列为SEQ ID NO:45~68中的任一条。本发明所提供的四重标签引物组中增加了平衡碱基序列,增加了文库多样性,提高了测序质量,在上机测序时仅需混合少量PhiX文库,并进行错位测序,减少了测序通量的浪费,保证了测序质量。 | ||
搜索关键词: | 一种 用于 构建 16 srrna 基因 扩增 序文 引物 方法 | ||
【主权项】:
一种用于构建16S rRNA基因扩增子测序文库的四重标签引物组,其特征在于,所述四重标签引物组由第一步PCR两重标签引物对和第二步PCR两重标签引物对组成;所述第一步PCR两重标签引物对的上游引物的序列为SEQ ID NO:1~8中的任一条,下游引物的序列为SEQ ID NO:9~20中的任一条;所述第二步PCR两重标签引物对的上游引物的序列为SEQ ID NO:21~44中的任一条,下游引物的序列为SEQ ID NO:45~68中的任一条;所述第一步PCR两重标签引物对中的N和V代表由0~6个碱基组成的平衡碱基;其中,N选自以下7种上游平衡碱基中的任一种,V选自以下7种下游平衡碱基中的任一种:序号上游平衡碱基(5’‑3’)下游平衡碱基(5’‑3’)1空白空白2TA3GTTC4CGACTA5TGTAGATG6TGCGATCTCA7GAGTGGTTCTCT
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