[发明专利]一种基于深度测序检测玉米根际土壤微生物的方法及系统在审
| 申请号： | 201711257675.4 | 申请日： | 2017-12-04 |
| 公开（公告）号： | CN107904296A | 公开（公告）日： | 2018-04-13 |
| 发明（设计）人： | 曾兴;刘显君;王康;邸宏;王振华 | 申请（专利权）人： | 东北农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 成都环泰知识产权代理事务所(特殊普通合伙)51242 | 代理人： | 邹翠,李斌 |
| 地址： | 150030 黑龙*** | 国省代码： | 黑龙江;23 |
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| 摘要： | 本发明属于土壤微生物学技术领域，公开了一种基于深度测序检测玉米根际土壤微生物的方法及系统，采集根际土壤；从土壤中提取高质量微生物基因组DNA；用双标签引物做PCR扩增DNA中16S rDNA V4区,构建文库；对合格文库进行测序，得到纯净READS；5.拼接，每样品产出至少5.0万条有效TAG用于聚类成可操作分类单元；6.物种组成、结构、多样性及相对丰度差异显著性分析；7.准确测定转基因耐盐碱玉米根际土壤原核微生物群落组成、结构、多样性、相对丰度。本发明受国家转基因重大专项课题“转基因玉米小麦大豆环境安全评价技术(2016ZX08011003)”支持。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 深度 检测 玉米 土壤 微生物 方法 系统 | ||
【主权项】：
一种基于深度测序检测玉米根际土壤微生物的方法，其特征在于，所述基于深度测序检测玉米根际土壤微生物的方法包括：用双标签融合引物对做PCR扩增转基因耐盐碱玉米种植区土壤样品中提取的微生物宏基因组DNA中的16S rDNA V4区，构建文库；对合格文库进行深度测序，得到纯净READS；拼接成TAG，土壤样品产出至少5.0万条有效TAG用于聚类成可操作分类单元OTU。
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