[发明专利]一种基于相似性和双随机游走的微生物‑疾病关系预测方法在审
| 申请号： | 201711293802.6 | 申请日： | 2017-12-08 |
| 公开（公告）号： | CN107887023A | 公开（公告）日： | 2018-04-06 |
| 发明（设计）人： | 王建新;严承;张雅妍;李敏 | 申请（专利权）人： | 中南大学 |
| 主分类号： | G16H50/20 | 分类号： | G16H50/20;G06F19/24 |
| 代理公司： | 长沙市融智专利事务所43114 | 代理人： | 杨萍 |
| 地址： | 410083 湖南*** | 国省代码： | 湖南;43 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于相似性和双随机游走的微生物‑疾病关系预测方法，首先利用疾病基因关系和基因功能相似性信息构建疾病功能相似性；再根据已知的微生物疾病关系构建疾病高斯核相似性；在疾病功能相似性和高斯核相似性的基础上集成疾病最终相似性。微生物的相似性来源于已知微生物疾病关系的高斯核相似性。再将微生物相似性信息，疾病相似性信息，已知的微生物疾病关系信息集成到一个双层异构网络中。利用双随机游走方法在异构网络中进行微生物疾病关系预测。本发明能够对微生物疾病之间的关系进行预测，为生物实验提供基础依据，节省其人力物力成本。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 相似性 随机 游走 微生物 疾病 关系 预测 方法 | ||
【主权项】：
一种基于相似性和双随机游走的微生物‑疾病关系预测方法,其特征在于，包括以下步骤：步骤1：分别构建疾病功能相似性矩阵Dfunsim、疾病高斯核相似性矩阵KGIP,d和微生物高斯核相似性矩阵KGIP,m；步骤2：集成疾病功能相似性矩阵Dfunsim和疾病高斯核相似性矩阵KGIP,d得到疾病最终相似性矩阵Sd；将微生物高斯核相似性矩阵KGIP,m作为微生物最终相似性矩阵Sm；步骤3：根据已知的微生物‑疾病关系、微生物最终相似性矩阵Sm和疾病最终相似性矩阵Sd，构建一个双层的异构网络，利用双随机游走方法对微生物‑疾病对进行关联分数预测；关联分数越大，则对应的微生物‑疾病对存在关系的可能性越大。
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