[发明专利]一种肺癌相关的285基因靶向捕获测序试剂盒及其应用在审
| 申请号： | 201711361951.1 | 申请日： | 2017-12-18 |
| 公开（公告）号： | CN108148910A | 公开（公告）日： | 2018-06-12 |
| 发明（设计）人： | 张绪超;陈宇;吴一龙 | 申请（专利权）人： | 广东省人民医院(广东省医学科学院) |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;C12Q1/6806;C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人： | 苏运贞 |
| 地址： | 510080 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种肺癌相关的285基因靶向捕获测序试剂盒及其应用。本发明提供的试剂盒以探针杂交捕获为基础，能用于制备与肺癌相关的285基因的高通量文库，同时检测285个基因外显子上的全部变异位点，改变传统单基因检测价格昂贵，耗时长，操作繁琐等劣势。具有在肺癌的穿刺活检小样本中实现“单个小样本多基因的检测”，满足小样本最大化使用、获得最大信息量的临床实践需求。该试剂盒基于Ion Proton平台具有高准确性与高敏感性，并在石蜡样本残存DNA样本中检测结果稳定，较Sanger测序法具有明显优势。 | ||
| 搜索关键词： | 肺癌 小样本 捕获 测序试剂盒 基因靶向 试剂盒 检测 基因外显子 最大信息量 石蜡 变异位点 穿刺活检 高敏感性 检测结果 探针杂交 单基因 多基因 高通量 最大化 文库 制备 应用 耗时 样本 基因 | ||
【主权项】：
一种肺癌相关的285基因靶向捕获测序试剂盒，其特征在于包含能杂交捕获到285个基因的探针，如下：JAK2探针如SEQIDNO.1所示；PTPRD探针如SEQIDNO.2所示；CDKN2A探针如SEQIDNO.3所示；FANCG探针如SEQIDNO.4所示；PAX5探针如SEQIDNO.5所示；GNAQ探针如SEQIDNO.6所示；NTRK2探针如SEQIDNO.7所示；FANCC探针如SEQIDNO.8所示；PTCH1探针如SEQIDNO.9所示；XPA探针如SEQIDNO.10所示；KLF4探针如SEQIDNO.11所示；TLR4探针如SEQIDNO.12所示；ABL1探针如SEQIDNO.13所示；TSC1探针如SEQIDNO.14所示；NOTCH1探针如SEQIDNO.15所示；RPL22探针如SEQIDNO.16所示；MTOR探针如SEQIDNO.17所示；SDHB探针如SEQIDNO.18所示；ARID1A探针如SEQIDNO.19所示；MYCL1探针如SEQIDNO.20所示；MPL探针如SEQIDNO.21所示；MUTYH探针如SEQIDNO.22所示；CDKN2C探针如SEQIDNO.23所示；JAK1探针如SEQIDNO.24所示；FUBP1探针如SEQIDNO.25所示；RPL5探针如SEQIDNO.26所示；NRAS探针如SEQIDNO.27所示；NOTCH2探针如SEQIDNO.28所示；NTRK1探针如SEQIDNO.29所示；B4GALT3探针如SEQIDNO.30所示；SDHC探针如SEQIDNO.31所示；DDR2探针如SEQIDNO.32所示；ABL2探针如SEQIDNO.33所示；CDC73探针如SEQIDNO.34所示；ELF3探针如SEQIDNO.35所示；MDM4探针如SEQIDNO.36所示；H3F3A探针如SEQIDNO.37所示；FH探针如SEQIDNO.38所示；AKT3探针如SEQIDNO.39所示；CDKN1B探针如SEQIDNO.40所示；KRAS探针如SEQIDNO.41所示；H3F3C探针如SEQIDNO.42所示；LRRK2探针如SEQIDNO.43所示；ARID2探针如SEQIDNO.44所示；MLL2探针如SEQIDNO.45所示；ACVR1B探针如SEQIDNO.46所示；ERBB3探针如SEQIDNO.47所示；CDK4探针如SEQIDNO.48所示；MDM2探针如SEQIDNO.49所示；NAV3探针如SEQIDNO.50所示；ASCL4探针如SEQIDNO.51所示；PTPN11探针如SEQIDNO.52所示；TBX3探针如SEQIDNO.53所示；HNF1A探针如SEQIDNO.54所示；MYCN探针如SEQIDNO.55所示；DNMT3A探针如SEQIDNO.56所示；ALK探针如SEQIDNO.57所示；EPCAM探针如SEQIDNO.58所示；MSH2探针如SEQIDNO.59所示；MSH6探针如SEQIDNO.60所示；FANCL探针如SEQIDNO.61所示；PCBP1探针如SEQIDNO.62所示；TMEM127探针如SEQIDNO.63所示；BCL2L11探针如SEQIDNO.64所示；ERCC3探针如SEQIDNO.65所示；LRP1B探针如SEQIDNO.66所示；ACVR2A探针如SEQIDNO.67所示；NFE2L2探针如SEQIDNO.68所示；PMS1探针如SEQIDNO.69所示；SF3B1探针如SEQIDNO.70所示；CASP8探针如SEQIDNO.71所示；IDH1探针如SEQIDNO.72所示；ERBB4探针如SEQIDNO.73所示；CUL3探针如SEQIDNO.74所示；DIS3L2探针如SEQIDNO.75所示；HRAS探针如SEQIDNO.76所示；CDKN1C探针如SEQIDNO.77所示；LMO1探针如SEQIDNO.78所示；FANCF探针如SEQIDNO.79所示；WT1探针如SEQIDNO.80所示；EXT2探针如SEQIDNO.81所示；MAPK8IP1探针如SEQIDNO.82所示；DDB2探针如SEQIDNO.83所示；SDHAF2探针如SEQIDNO.84所示；MEN1探针如SEQIDNO.85所示；AIP探针如SEQIDNO.86所示；CCND1探针如SEQIDNO.87所示；CEP57探针如SEQIDNO.88所示；ATM探针如SEQIDNO.89所示；SDHD探针如SEQIDNO.90所示；CBL探针如SEQIDNO.91所示；AJUBA探针如SEQIDNO.92所示；NKX2‑1探针如SEQIDNO.93所示；FOXA1探针如SEQIDNO.94所示；FANCM探针如SEQIDNO.95所示；MAX探针如SEQIDNO.96所示；TSHR探针如SEQIDNO.97所示；DICER1探针如SEQIDNO.98所示；AKT1探针如SEQIDNO.99所示；STK11探针如SEQIDNO.100所示；GNA11探针如SEQIDNO.101所示；DNMT1探针如SEQIDNO.102所示；TYK2探针如SEQIDNO.103所示；KEAP1探针如SEQIDNO.104所示；SMARCA4探针如SEQIDNO.105所示；JAK3探针如SEQIDNO.106所示；TSHZ3探针如SEQIDNO.107所示；CEBPA探针如SEQIDNO.108所示；KMT2B探针如SEQIDNO.109所示；AKT2探针如SEQIDNO.110所示；PRX探针如SEQIDNO.111所示；CIC探针如SEQIDNO.112所示；ERCC2探针如SEQIDNO.113所示；ARHGAP35探针如SEQIDNO.114所示；PPP2R1A探针如SEQIDNO.115所示；SKP2探针如SEQIDNO.116所示；LIFR探针如SEQIDNO.117所示；MAP3K1探针如SEQIDNO.118所示；PIK3R1探针如SEQIDNO.119所示；RASA1探针如SEQIDNO.120所示；APC探针如SEQIDNO.121所示；CSF1R探针如SEQIDNO.122所示；NPM1探针如SEQIDNO.123所示；FGFR4探针如SEQIDNO.124所示；NSD1探针如SEQIDNO.125所示；CRLF2探针如SEQIDNO.126所示；FANCB探针如SEQIDNO.127所示；BCOR探针如SEQIDNO.128所示；USP9X探针如SEQIDNO.129所示；KDM6A探针如SEQIDNO.130所示；GATA1探针如SEQIDNO.131所示；KDM5C探针如SEQIDNO.132所示；SMC1A探针如SEQIDNO.133所示；FAM123B探针如SEQIDNO.134所示；AR探针如SEQIDNO.135所示；MED12探针如SEQIDNO.136所示；TAF1探针如SEQIDNO.137所示；ATRX探针如SEQIDNO.138所示；PAK3探针如SEQIDNO.139所示；STAG2探针如SEQIDNO.140所示；GPC3探针如SEQIDNO.141所示；PHF6探针如SEQIDNO.142所示；HIST1H3B探针如SEQIDNO.143所示；HIST1H1C探针如SEQIDNO.144所示；HIST1H2BD探针如SEQIDNO.145所示；HLA‑A探针如SEQIDNO.146所示；DDR1探针如SEQIDNO.147所示；DAXX探针如SEQIDNO.148所示；FANCE探针如SEQIDNO.149所示；CDKN1A探针如SEQIDNO.150所示；PRDM1探针如SEQIDNO.151所示；ROS1探针如SEQIDNO.152所示；TNFAIP3探针如SEQIDNO.153所示；ARID1B探针如SEQIDNO.154所示；GATA3探针如SEQIDNO.155所示；RET探针如SEQIDNO.156所示；ARID5B探针如SEQIDNO.157所示；PRF1探针如SEQIDNO.158所示；BMPR1A探针如SEQIDNO.159所示；PTEN探针如SEQIDNO.160所示；SUFU探针如SEQIDNO.161所示；SMC3探针如SEQIDNO.162所示；FGFR2探针如SEQIDNO.163所示；PDYN探针如SEQIDNO.164所示；FOXA2探针如SEQIDNO.165所示；ASXL1探针如SEQIDNO.166所示；SRC探针如SEQIDNO.167所示；NCOA3探针如SEQIDNO.168所示；TSHZ2探针如SEQIDNO.169所示；GNAS探针如SEQIDNO.170所示；FANCD2探针如SEQIDNO.171所示；VHL探针如SEQIDNO.172所示；XPC探针如SEQIDNO.173所示；TGFBR2探针如SEQIDNO.174所示；MLH1探针如SEQIDNO.175所示；MYD88探针如SEQIDNO.1 76所示；CTNNB1探针如SEQIDNO.177所示；SETD2探针如SEQIDNO.178所示；MST1R探针如SEQIDNO.179所示；SLC38A3探针如SEQIDNO.180所示；ZMYND10探针如SEQIDNO.181所示；BAP1探针如SEQIDNO.182所示；PBRM1探针如SEQIDNO.183所示；FOXP1探针如SEQIDNO.184所示；EPHA3探针如SEQIDNO.185所示；POLQ探针如SEQIDNO.186所示；GATA2探针
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