[发明专利]氨基酸序列特征提取方法、装置、存储介质及电子设备有效
| 申请号： | 201711377471.4 | 申请日： | 2017-12-19 |
| 公开（公告）号： | CN108229102B | 公开（公告）日： | 2020-06-12 |
| 发明（设计）人： | 汤一凡;崔朝辉;赵立军;张霞 | 申请（专利权）人： | 东软集团股份有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00 |
| 代理公司： | 北京英创嘉友知识产权代理事务所(普通合伙) 11447 | 代理人： | 南毅宁;魏嘉熹 |
| 地址： | 110179 辽*** | 国省代码： | 辽宁;21 |
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| 摘要： | 本公开涉及一种氨基酸序列特征提取方法、装置、存储介质及电子设备。该方法包括：获取待进行特征提取的氨基酸序列；确定所述氨基酸序列的位置特异性得分矩阵PSSM；确定每种预设氨基酸在[‑S,S]分数区间内的得分分布；合并M种预设氨基酸的所述得分分布，以获得所述氨基酸序列的特征向量。由于确定出的氨基酸序列的位置特异性得分矩阵PSSM中蕴含有同源蛋白质信息，因此该位置特异性得分矩阵PSSM表示成的特征向量中能够融入更多的序列保守信息，更有利于氨基酸序列与其他生物高分子物质之间的相互作用的预测，且预测效率高。并且，能够将位置特异性得分矩阵PSSM转换成固定长度的特征向量，为氨基酸序列特征提供了一种多维空间表达方式。 | ||
| 搜索关键词： | 氨基酸 序列 特征 提取 方法 装置 存储 介质 电子设备 | ||
【主权项】：
1.一种氨基酸序列特征提取方法，其特征在于，所述方法包括：获取待进行特征提取的氨基酸序列；确定所述氨基酸序列的位置特异性得分矩阵PSSM，其中，所述位置特异性得分矩阵PSSM的大小为N×M，N表示所述氨基酸序列的序列长度，M表示预设氨基酸的总数，所述位置特异性得分矩阵PSSM中的每个分数PSSM(n,m)表示在第n行的氨基酸的位置下，第m列的预设氨基酸出现的倾向程度，且‑S≤PSSM(n,m)≤S，其中，N、M和S均为正整数，且1≤n≤N，1≤m≤M；确定每种预设氨基酸在[‑S,S]分数区间内的得分分布；合并M种预设氨基酸的所述得分分布，以获得所述氨基酸序列的特征向量。
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